计算化学公社

标题: 计算过渡态的疑惑跪求大神解决 [打印本页]

作者
Author: hongjianji2006 时间: 2021-5-6 23:20
标题: 计算过渡态的疑惑跪求大神解决
好几天了，计算一分子过渡态一直出现：202.exe is processing.....Center    Atomic                Forces (Hartrees/Bohr)
Number    Number             X             Y             Z
-------------------------------------------------------------------
   1       6          0.000001110 0.000003280 0.000001230
   2       6          0.000002885 -0.000005608 0.000000247
   3       6       -0.000007686 0.000001019 -0.000003192
   4       6          0.000000756 0.000001336 0.000000023
   5       6          0.000001047 -0.000001718 0.000001126
   6       6       -0.000004058 -0.000003555 -0.000000959
   7       6          0.000007639 0.000000370 0.000005087
   8       6       -0.000000070 0.000002431 -0.000001557
   9       6       -0.000005028 -0.000003818 0.000000100
   10       6       -0.000000471 -0.000000536 -0.000003990
   11       6          0.000003476 0.000004135 -0.000000835
   12       6       -0.000001011 -0.000000604 -0.000000967
   13       6          0.000002345 0.000008552 0.000000416
   14       6       -0.000002088 -0.000004995 -0.000000703
   15       1          0.000000325 0.000001362 0.000000700
   16       1       -0.000000293 -0.000000817 -0.000000172
   17       1       -0.000001882 -0.000000183 -0.000000702
   18       1       -0.000001407 -0.000000110 -0.000000238
   19       1       -0.000000300 0.000000472 0.000000760
   20       6       -0.000003691 0.000003372 0.000000961
   21       8       -0.000003865 -0.000002842 -0.000002992
   22       8          0.000004764 -0.000000140 -0.000002922
   23       1       -0.000000179 0.000001607 -0.000001982
   24       1       -0.000000470 0.000000851 -0.000001732
   25       8       -0.000001094 -0.000004406 0.000002991
   26       1       -0.000002414 0.000002876 0.000005372
   27       1          0.000002256 0.000000263 -0.000001977
   28       8          0.000005049 0.000000264 -0.000003638
   29       6       -0.000005514 -0.000000370 0.000002734
   30       1          0.000001681 -0.000001549 0.000001164
   31       1          0.000000765 -0.000001196 0.000000233
   32       1          0.000000830 -0.000001989 0.000000184
   33       7          0.000009119 0.000005795 0.000017182
   34       8          0.000000038 -0.000006202 -0.000001499
   35       8       -0.000007447 -0.000001078 -0.000013484
   36       8          0.000006738 -0.000004405 0.000000131
   37       6       -0.000001855 0.000008134 0.000002902
-------------------------------------------------------------------
Cartesian Forces:  Max    0.000017182 RMS    0.000003757
IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC
      ******** Start new reaction path calculation ********
WARNING: NO IMAGINARY FREQUENCIES AT TS!
Supplied step size of 0.1000 bohr.
Integration on MW PES will use step size of 0.2671 sqrt(amu)*bohr.
Point Number: 0       Path Number: 1
Calculating another point on the path.
PES minimum detected within a second-order step.
Calculation of FORWARD path complete.
Beginning calculation of the REVERSE path.

Calculating another point on the path.
IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC
                        Input orientation:
---------------------------------------------------------------------
Center    Atomic    Atomic          Coordinates (Angstroms)
Number    Number    Type          X          Y          Z
---------------------------------------------------------------------
   1       6          0          NaN       NaN       NaN
   2       6          0          NaN       NaN       NaN
   3       6          0          NaN       NaN       NaN
   4       6          0          NaN       NaN       NaN
   5       6          0          NaN       NaN       NaN
   6       6          0          NaN       NaN       NaN
   7       6          0          NaN       NaN       NaN
   8       6          0          NaN       NaN       NaN
   9       6          0          NaN       NaN       NaN
   10       6          0          NaN       NaN       NaN
   11       6          0          NaN       NaN       NaN
   12       6          0          NaN       NaN       NaN
   13       6          0          NaN       NaN       NaN
   14       6          0          NaN       NaN       NaN
   15       1          0          NaN       NaN       NaN
   16       1          0          NaN       NaN       NaN
   17       1          0          NaN       NaN       NaN
   18       1          0          NaN       NaN       NaN
   19       1          0          NaN       NaN       NaN
   20       6          0          NaN       NaN       NaN
   21       8          0          NaN       NaN       NaN
   22       8          0          NaN       NaN       NaN
   23       1          0          NaN       NaN       NaN
   24       1          0          NaN       NaN       NaN
   25       8          0          NaN       NaN       NaN
   26       1          0          NaN       NaN       NaN
   27       1          0          NaN       NaN       NaN
   28       8          0          NaN       NaN       NaN
   29       6          0          NaN       NaN       NaN
   30       1          0          NaN       NaN       NaN
   31       1          0          NaN       NaN       NaN
   32       1          0          NaN       NaN       NaN
   33       7          0          NaN       NaN       NaN
   34       8          0          NaN       NaN       NaN
   35       8          0          NaN       NaN       NaN
   36       8          0          NaN       NaN       NaN
   37       6          0          NaN       NaN       NaN
---------------------------------------------------------------------
                  Distance matrix (angstroms):
                  1       2       3       4       5
   1  C       NaN
   2  C       NaN       NaN
   3  C       NaN       NaN       NaN
   4  C       NaN       NaN       NaN       NaN
   5  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
   6  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
   7  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
   8  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
   9  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
10  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
11  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
12  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
13  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
14  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
15  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
16  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
17  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
18  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
19  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
20  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
21  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
22  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
23  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
24  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
25  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
26  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
27  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
28  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
29  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
30  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
31  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
32  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
33  N       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
34  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
35  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
36  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
37  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
                  6       7       8       9       10
   6  C       NaN
   7  C       NaN       NaN
   8  C       NaN       NaN       NaN
   9  C       NaN       NaN       NaN       NaN
10  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
11  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
12  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
13  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
14  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
15  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
16  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
17  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
18  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
19  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
20  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
21  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
22  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
23  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
24  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
25  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
26  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
27  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
28  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
29  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
30  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
31  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
32  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
33  N       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
34  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
35  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
36  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
37  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
               11       12       13       14       15
11  C       NaN
12  C       NaN       NaN
13  C       NaN       NaN       NaN
14  C       NaN       NaN       NaN       NaN
15  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
16  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
17  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
18  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
19  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
20  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
21  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
22  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
23  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
24  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
25  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
26  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
27  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
28  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
29  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
30  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
31  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
32  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
33  N       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
34  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
35  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
36  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
37  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
               16       17       18       19       20
16  H       NaN
17  H       NaN       NaN
18  H       NaN       NaN       NaN
19  H       NaN       NaN       NaN       NaN
20  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
21  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
22  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
23  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
24  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
25  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
26  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
27  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
28  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
29  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
30  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
31  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
32  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
33  N       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
34  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
35  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
36  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
37  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
               21       22       23       24       25
21  O       NaN
22  O       NaN       NaN
23  H       NaN       NaN       NaN
24  H       NaN       NaN       NaN       NaN
25  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
26  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
27  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
28  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
29  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
30  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
31  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
32  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
33  N       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
34  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
35  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
36  O       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
37  C       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
               26       27       28       29       30
26  H       NaN
27  H       NaN       NaN
28  O       NaN       NaN       NaN
29  C       NaN       NaN       NaN       NaN
30  H       NaN       NaN       NaN       NaN       NaN
31  H       NaN

Reorienting Coordinates,Calculating Symmetry,and Checking Variables，

我的微信号：13485259110

作者
Author: hongjianji2006 时间: 2021-5-6 23:22
不知道这种情况正常吗？好几天了，什么原因呢？如何解决？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-5-7 03:20

hongjianji2006 发表于 2021-5-6 16:22
不知道这种情况正常吗？好几天了，什么原因呢？如何解决？

NO IMAGINARY FREQUENCIES AT TS
这句话看到了吗？过渡态有虚频吗？如果没有虚频，必须找到恰有一个虚频的结构，才能跑IRC。不能不检查虚频数目就跑IRC。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-5-7 03:30

hongjianji2006 发表于 2021-5-6 23:22
不知道这种情况正常吗？好几天了，什么原因呢？如何解决？

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，这点在置顶的新社员必读贴里明确说了

作者
Author: sobereva 时间: 2021-5-7 03:32
你这根本就不是找过渡态，而是跑IRC。发帖时候（包括标题）必须表述正确、严谨

仔细自行根据提示判断
有一条明显是需要注意的：
WARNING: NO IMAGINARY FREQUENCIES AT TS!
即初始结构没有虚频，要么用的结构有问题，要么影响能量的关键词和找TS时不符等等
仔细看此文了解必须注意的各种事项
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400（http://bbs.keinsci.com/thread-7736-1-1.html）

本论坛是专业、高档次的正经讨论问题的地方，不是小*虫那种水准的地方。帖子标题别写什么“跪求”，也别留什么微信号，不要指望别人会上赶地加你微信回你问题。有问题一律通过帖子讨论。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)