计算化学公社

标题: 求助:轨迹帧数的提取 [打印本页]

作者
Author:
蓝沐轩_lemshine    时间: 2021-5-7 17:58
标题: 求助:轨迹帧数的提取
请教大家一个问题,我想在50ns轨迹(10ns有5000帧,50ns共25000帧)中,隔250ns提取一帧得到100个pdb文件,怎么实现呢?轨迹是amber中的nc格式

作者
Author:
sobereva    时间: 2021-5-8 01:52
轨迹总共才50ns,怎么可能250ns提取一帧

仔细看ambertools里cpptraj部分找相关的关键词,没有的话,自己写个VMD脚本实现,在以下脚本上举一反三
(, 下载次数 Times of downloads: 29)

作者
Author:
蓝沐轩_lemshine    时间: 2021-5-8 10:20
不好意思 老师 我写错了,是250帧提一次 谢谢sob老师
作者
Author:
冷血    时间: 2021-5-8 10:40
咋感觉你这问题在好多地方都问过了。。
作者
Author:
Albert0906    时间: 2021-5-8 15:08
试试cpptraj。去搜cpptraj的trajin,在amber20手册的32.10.4。
作者
Author:
蓝沐轩_lemshine    时间: 2021-5-8 19:27
好的 谢谢




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3