计算化学公社

标题: 求助dmol3态密度计算后无法分析PDOS [打印本页]

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Author: 居里的小迷妹 时间: 2021-5-8 17:18
标题: 求助dmol3态密度计算后无法分析PDOS
请问大家有遇到这样问题吗？性质分析时总dos可以分析作图，但pdos 栏选项框为灰色，无法选择，应该怎么解决呢？

作者
Author: 卡开发发 时间: 2021-5-8 17:21
计算性质的是否是否勾选Calculation PDOS？

作者
Author: 居里的小迷妹 时间: 2021-5-8 17:33

卡开发发发表于 2021-5-8 17:21
计算性质的是否是否勾选Calculation PDOS？

谢谢老师，没有勾选，真是犯了低级错误

作者
Author: xiapin 时间: 2021-7-14 21:33
本帖最后由 xiapin 于 2021-7-14 21:52 编辑

卡开发发发表于 2021-5-8 17:21
计算性质的是否是否勾选Calculation PDOS？

卡开发发老师，我在用Dmol3计算石墨烯负载金属结构的态密度时候导出DOS和PDOS图在 0 ev处有条竖直的虚线，请问这个是费米能级吗？
另外还想问：1.在0处几乎没有很高的峰值，曲线都是在0上方一点点，请问这个正常吗？导师问我画图之前有没有处理费米能级，我也不太懂怎么操作。还以为直接dmol3得到的数据在origin作图就行了。
2.纵轴的数据数据达到了300eV,但我看文献中都是几十eV,这个有没有影响？辛苦老师看下。opt优化时k点选的gamma点，计算DOS选了fine。

作者
Author: 乐平 时间: 2021-7-15 09:49

xiapin 发表于 2021-7-14 15:33
卡开发发老师，我在用Dmol3计算石墨烯负载金属结构的态密度时候导出DOS和PDOS图在 0 ev处有条竖直的虚线 ...

M$ 套装里的 DMol3、 CASTEP 都已经自动把费米能级校正了，也就是做了 E - Ef，所以 0 eV 的竖直虚线就是你说的费米能级。

1） 0 eV 处几乎没有峰，对于石墨烯很正常啊。石墨烯负载金属得具体看什么结构，建议和文献对比。
2）文献里的参数和你的计算参数一致吗？lattice parameters, cut off energy, k-point, convergence criteria

另外， total DOS 的颜色能不能换一换？跟 p-轨道的颜色太接近了，容易混淆（建议换成黑色）；d-轨道的颜色也换一换，翠绿色实在是不友好（屏幕显示，打印，尤其是投影的时候更糟糕），换成墨绿色会好很多。

作者
Author: xiapin 时间: 2021-7-15 10:23

乐平发表于 2021-7-15 09:49
M$ 套装里的 DMol3、 CASTEP 都已经自动把费米能级校正了，也就是做了 E - Ef，所以 0 eV 的竖直虚线就是 ...

好的，谢谢您的回复，很有帮助，我去对比文献。

作者
Author: 卡开发发 时间: 2021-7-15 10:32

xiapin 发表于 2021-7-14 21:33
卡开发发老师，我在用Dmol3计算石墨烯负载金属结构的态密度时候导出DOS和PDOS图在 0 ev处有条竖直的虚线 ...

0、竖线是Fermi能级。
1、平整的石墨烯0eV应该几乎没峰，这个做的文献比较多可以直接参考。处理Fermi能级我不太了解你导师的意思，正常情况能级是按照E-Ef处理，在MS中已经这样处理过。但如果要了解相对于真空的情况，还得修正真空能级。
2、纵轴300的单位不是eV，而是Electron/eV，和你体系电子数目有关。如果你计算的是个超晶格，得到的DOS应该会比文献中使用更小晶格来的值大。至于只取Gamma是否合理，这点我不好说，建议做好测试。

作者
Author: hjrtion 时间: 2021-11-26 14:47

卡开发发发表于 2021-5-8 17:21
计算性质的是否是否勾选Calculation PDOS？

前辈您好，我在看您的回复中受益匪浅，现在想请教一下用dmol3算出d轨道的pdos以后，是否有办法像vasp的p4vasp分出具体的轨道呢，如dxy这种，感谢！

作者
Author: 卡开发发 时间: 2021-11-26 14:55

hjrtion 发表于 2021-11-26 14:47
前辈您好，我在看您的回复中受益匪浅，现在想请教一下用dmol3算出d轨道的pdos以后，是否有办法像vasp的p4 ...

没办法，而且其实意义也不大，那个会随着晶体朝向而发生变化。

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