计算化学公社

标题: GaussView构建氧化钙与氢氧化钙晶体求助 [打印本页]

作者
Author:
yang2020    时间: 2021-5-8 21:17
标题: GaussView构建氧化钙与氢氧化钙晶体求助
(, 下载次数 Times of downloads: 24) (, 下载次数 Times of downloads: 33)
请教各位老师,怎么用GaussView构建氧化钙和氢氧化钙晶体呢?上图中对吗?


我在这个网站里面(http://www.chemspider.com/)下载了氧化钙和氢氧化钙的结构,但是明显原子数不对,请问这是什么原因?
(, 下载次数 Times of downloads: 34) (, 下载次数 Times of downloads: 26)

作者
Author:
wzkchem5    时间: 2021-5-8 22:07
不是,你这样构建的是分子,不是晶体。晶体结构应该去找无机物质的晶体数据库下载。如果事先不知道这两个晶体的堆积方式,是不可能从头画出来的,这和画分子不一样。
chemspider是针对生物分子/类药有机分子之类的设计的,会自动补氢,所以氢原子数不对。不要从这种数据库下载结构。
作者
Author:
喵星大佬    时间: 2021-5-8 22:25
去materials project上搜一下就有了
P-3m1的晶体

作者
Author:
yang2020    时间: 2021-5-8 22:32
wzkchem5 发表于 2021-5-8 22:07
不是,你这样构建的是分子,不是晶体。晶体结构应该去找无机物质的晶体数据库下载。如果事先不知道这两个晶 ...

嗯嗯嗯,谢谢老师的解答
作者
Author:
yang2020    时间: 2021-5-8 22:33
喵星大佬 发表于 2021-5-8 22:25
去materials project上搜一下就有了
P-3m1的晶体

谢谢老师的耐心解答。请问 P-3m1 指的是氢氧化钙的意思吗
作者
Author:
喵星大佬    时间: 2021-5-8 22:52
yang2020 发表于 2021-5-8 22:33
谢谢老师的耐心解答。请问 P-3m1 指的是氢氧化钙的意思吗

空间群啊。。。。上标横线打不上去
作者
Author:
yang2020    时间: 2021-5-9 10:23
喵星大佬 发表于 2021-5-8 22:52
空间群啊。。。。上标横线打不上去

好的,谢谢老师




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3