计算化学公社

标题: slurm调度并行计算集群搭建实录 [打印本页]

作者
Author: abin 时间: 2021-5-9 15:45
标题: slurm调度并行计算集群搭建实录
本帖最后由 abin 于 2021-5-9 15:54 编辑

视频实录。

通过虚拟机演示，
从centOS8最小安装开始，
逐步调试为适用于计算化学的并行计算集群。
部分打字输入过程有剪辑；部分yum install环节有加速。

视频内容涵盖，适用于计算化学之用的服务器的安装，存储设定，NFS设定，NIS设定，slurm源码编译以及配置。
所有技术流程均来自于各解决方案的官方手册。
视频仅供参考。

视频链接

https://b23.tv/jIF9Kh

https://youtu.be/kZHrfY3P2Ts

作者
Author: 风飞 时间: 2021-6-6 22:49
老师，您好，我的系统是centos 7.8 ,由于升级了gcc (从4.8.5 升级到8.3.0 ，以致于我的之前的torque PBS在提交任务时出现问题，现在拟装slurm ，看到了您帖子，请问按照您的步骤安装，合适吗？

作者
Author: abin 时间: 2021-6-7 09:31

风飞发表于 2021-6-6 22:49
老师，您好，我的系统是centos 7.8 ,由于升级了gcc (从4.8.5 升级到8.3.0 ，以致于我的之前的torque PBS在 ...

撤销你自己安装的GCC即可。

如果实在想手动安装GCC高版本，
可以参考：
GCC9源码编译
https://www.bilibili.com/video/BV1HJ411H7Ca
视频中的技术方案，适用于绕开root授权，给自己安装软件的场景。

或者使用这个方案获取高版本工具：
https://www.softwarecollections.org/en/

从PBS系列，切换到slurm，需要先清空之前的队列设定。

更多解决方案，可以查阅https://gitee.com/hpc4you/linux 自行了解。

祝好。

作者
Author: 风飞 时间: 2021-6-7 12:27
本帖最后由风飞于 2021-6-7 12:39 编辑

abin 发表于 2021-6-7 09:31
撤销你自己安装的GCC即可。

如果实在想手动安装GCC高版本，

我升级gcc是为了安装cp2k. 请问按照你说的哪种方法安装gcc可以呢？

作者
Author: abin 时间: 2021-6-7 13:42

风飞发表于 2021-6-7 12:27
我升级gcc是为了安装cp2k. 请问按照你说的哪种方法安装gcc可以呢？

如果实在想手动安装GCC高版本，
可以参考：
GCC9源码编译
https://www.bilibili.com/video/BV1HJ411H7Ca
视频中的技术方案，适用于绕开root授权，给自己安装软件的场景。

或者使用这个方案获取高版本工具：
https://www.softwarecollections.org/en/

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以上内容，请仔细阅读。

另，我有针对intel处理器优化编译的cp2k，支持AVX512指令集，有需要可以联系我。

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