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标题: VMD分析氢键遇到错误 [打印本页]

作者
Author: 爱模拟的bao 时间: 2021-5-9 17:37
标题: VMD分析氢键遇到错误
我用VMD分析Hydrogen bonds时出现了如下的错误，不知道怎么修改呢？我设置的是：
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作者
Author: sobereva 时间: 2021-5-10 03:33
至少对于1.9.3版，VMD的绘图功能有bug，把Plot the data with Multiplot取消掉

作者
Author: 爱模拟的bao 时间: 2021-5-10 08:14

sobereva 发表于 2021-5-10 03:33
至少对于1.9.3版，VMD的绘图功能有bug，把Plot the data with Multiplot取消掉

好的呢，谢谢了呢，我试试呢。

作者
Author: 爱模拟的bao 时间: 2021-5-10 11:20
本帖最后由爱模拟的bao 于 2021-5-10 15:50 编辑

爱模拟的bao 发表于 2021-5-10 08:14
好的呢，谢谢了呢，我试试呢。

老师，我可以在VMD里看到氢键[img]"，但是计算出来的氢键都是零呢，这是什么原因啊？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-5-10 13:43

爱模拟的bao 发表于 2021-5-10 11:20
老师，我可以在VMD里看到氢键，但是计算出来的氢键都是零呢，这是什么原因啊？

贴图方式不对，其他人看不到。重新编辑帖子并仔细看置顶的新社员必读贴了解怎么正确贴图

作者
Author: 爱模拟的bao 时间: 2021-5-10 15:51

sobereva 发表于 2021-5-10 13:43
贴图方式不对，其他人看不到。重新编辑帖子并仔细看置顶的新社员必读贴了解怎么正确贴图

修改了呢，老师。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-5-11 05:43

爱模拟的bao 发表于 2021-5-10 11:20
老师，我可以在VMD里看到氢键"，但是计算出来的氢键都是零呢，这是什么原因啊？

选区没设对
光写name O肯定不行，程序根据给体重原子和相连的氢一起来判断给体原子

作者
Author: 爱模拟的bao 时间: 2021-5-11 09:44

sobereva 发表于 2021-5-11 05:43
选区没设对
光写name O肯定不行，程序根据给体重原子和相连的氢一起来判断给体原子

好的，谢谢老师。

作者
Author: LSY0202 时间: 2021-8-26 11:04

爱模拟的bao 发表于 2021-5-11 09:44
好的，谢谢老师。

所以你是怎么设置的啊，我也遇到了和你相同的问题

作者
Author: s541040349 时间: 2022-5-17 21:19
你好，请问解决了吗

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-30 06:47

LSY0202 发表于 2021-8-26 11:04
所以你是怎么设置的啊，我也遇到了和你相同的问题

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-30 06:47

s541040349 发表于 2022-5-17 21:19
你好，请问解决了吗

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