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标题: pdb2gmx处理蛋白C端时，CT2和3TER有什么区别吗？ [打印本页]

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Author: 金水河的春天 时间: 2021-5-12 08:29
标题: pdb2gmx处理蛋白C端时，CT2和3TER有什么区别吗？
老师这两天考我，让我说出这些Terminus的区别，我不是很清楚，本来想每个都加下进行对比，发现3TER加不了，有哪位老师清楚他们的区别吗？感谢您的不吝赐教

作者
Author: sobereva 时间: 2021-5-12 13:47
核酸有5端和3端之分

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Author: 金水河的春天 时间: 2021-5-12 14:23

sobereva 发表于 2021-5-12 13:47
核酸有5端和3端之分

卢老师，我是想问3TER这种端基和CT2在结构上和性质上有什么区别吗？百度谷歌都没看到

作者
Author: sobereva 时间: 2021-5-12 16:36
搞清楚核酸的结构自然就清楚
蛋白质残基怎么可能指认成5、3端，又不是核酸

搞清楚力场目录下后缀是.c.tdb、.n.tdb文件是干嘛的，看里面的信息理解

PS：说google就完了，百毒太low了，哪是搜和学术有关的东西能用的

作者
Author: 金水河的春天 时间: 2021-5-12 18:19

sobereva 发表于 2021-5-12 16:36
搞清楚核酸的结构自然就清楚
蛋白质残基怎么可能指认成5、3端，又不是核酸

谢谢卢老师，我看到您书里蛋白质的模拟有这部分的讲解，之前只看了rtp文件，我再去看看tdb文件

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