计算化学公社

标题: LOL图像结果分析 [打印本页]

作者
Author: 小书童 时间: 2015-12-5 16:06
标题: LOL图像结果分析
本帖最后由小书童于 2015-12-5 18:24 编辑

看老师的帖子，自己试着做了两个LOL图，想分析Pb与周围原子的成键特性。
1、不知道如何分析现有的图像
2、不知道如何改变图像大小，就是明显图像有一部分没有在里面，超出了图框范围
3、不知道怎么把图像摆正
求老师帮忙解答，一下，附上其中一个FCHK文件

作者
Author: 小书童 时间: 2015-12-5 16:32
第二个问题现在已经解决了，但是剩下两个还不会

作者
Author: sobereva 时间: 2015-12-5 18:33
1 哪里数值高哪里定域性就强。C-Pb之间明显有数值较大区域，明显是对应定域性较强的共价键。并且Pb朝外LOL还有一块数值较大区域，应当是它的孤对电子
3 自行ps

作者
Author: 小书童 时间: 2015-12-5 18:58

sobereva 发表于 2015-12-5 18:33
1 哪里数值高哪里定域性就强。C-Pb之间明显有数值较大区域，明显是对应定域性较强的共价键。并且Pb朝外LOL ...

1、黄色说明是0.5以上，我看好像这个0.5是一个分界线，0.5以上说明是共价键，0.5一下说明是离子键？
2、Pb朝外还有一块区域是孤对电子，这个是说明Pb还可以成键吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2015-12-6 01:43

小书童发表于 2015-12-5 18:58
1、黄色说明是0.5以上，我看好像这个0.5是一个分界线，0.5以上说明是共价键，0.5一下说明是离子键？
2、 ...

1 没有这回事
2 至少是有能力形成配位键

作者
Author: 小书童 时间: 2015-12-6 08:41
本帖最后由小书童于 2015-12-6 09:41 编辑

sobereva 发表于 2015-12-6 01:43
1 没有这回事
2 至少是有能力形成配位键

老师，那如何判断成键类型，我还是不懂，看两个原子之间有没有黄色的部分？有的话就是共价键，没有的话就是离子键？还有就是共价键的强弱如何判断呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2015-12-6 14:42

小书童发表于 2015-12-6 08:41
老师，那如何判断成键类型，我还是不懂，看两个原子之间有没有黄色的部分？有的话就是共价键，没有的话就 ...

你的情况一看就是共价键，ELF不好判断时结合能量密度判断，这里有涉及
AIM键临界点处电子密度拉普拉斯值符号判断相互作用类型失败原因的图形分析
http://sobereva.com/161

不懂ELF/LOL的话好好看这些资料，从原理上仔细领会
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=2100

强弱最直接的表征时计算键能。其它方式表征看具体情况。

作者
Author: 小书童 时间: 2015-12-6 16:28

sobereva 发表于 2015-12-6 14:42
你的情况一看就是共价键，ELF不好判断时结合能量密度判断，这里有涉及
AIM键临界点处电子密度拉普拉斯值 ...

老师，能量密度怎么计算啊？

作者
Author: sobereva 时间: 2015-12-6 23:09

小书童发表于 2015-12-6 16:28
老师，能量密度怎么计算啊？

帖子里写得很明确啊

（从Multiwfn 2.5版开始，只要将settings.ini文件中的iuserfunc设为11，则选择要绘制的实空间函数时选“100 User defined function”就等于选了能量密度。）

作者
Author: 小书童 时间: 2015-12-8 21:38

sobereva 发表于 2015-12-6 23:09
帖子里写得很明确啊

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