计算化学公社

标题: 使用Multiwfn做aRDG分析生成格点数据时盒子能否变为球形或者球壳 [打印本页]

作者
Author: chema 时间: 2021-5-13 08:28
标题: 使用Multiwfn做aRDG分析生成格点数据时盒子能否变为球形或者球壳
各位老师，小弟最近根据《使用Multiwfn研究分子动力学的弱相互作用》（http://sobereva.com/186）这一博文来分析自己的体系时，遇到一系问题，请大家不吝赐教

小弟的体系是一个球形的团簇（直径1.6nm）固定在水中跑动力学，在做aRDG分析时发现要想获得图形化表面与水的弱相互作用，就要设置很大的盒子和多的格点数，计算量很大，能不能通过一些设置把这个盒子形状改为球壳，或者是两个立方格子中间壳区域呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-5-13 08:48
不能
而且本来VMD也没法对那种格点显示等值面

顶多是为了节省计算量，修改格点循环部分的源代码，如果当前计算的位置不符合要求的几何判据，就直接跳到下一个格点。

作者
Author: chema 时间: 2021-5-13 09:35

sobereva 发表于 2021-5-13 08:48
不能
而且本来VMD也没法对那种格点显示等值面

好的，非常感谢老师的回答

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)