计算化学公社

标题: 请问高斯计算有机反应，金属离子盐如何处理 [打印本页]

作者
Author: jw227 时间: 2021-5-13 17:13
标题: 请问高斯计算有机反应，金属离子盐如何处理
请问，一些有机反应涉及到离子化合物，例如一些金属类路易斯酸盐，再例如成钠盐，那是直接用带负电离子作为反应物，还是要金属也加在反应计算中，很疑惑

作者
Author: 喵星大佬 时间: 2021-5-13 18:34
看溶剂，极性溶剂可以认为是离子，非极性溶剂就要好好考虑了

作者
Author: WMQueen 时间: 2021-5-24 13:27

喵星大佬发表于 2021-5-13 18:34
看溶剂，极性溶剂可以认为是离子，非极性溶剂就要好好考虑了

您好，我也遇到了这样的问题，我想请问非极性溶剂要如何考虑呢？需要两种情况都计算一下吗？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-5-24 17:33

WMQueen 发表于 2021-5-24 06:27
您好，我也遇到了这样的问题，我想请问非极性溶剂要如何考虑呢？需要两种情况都计算一下吗？

把抗衡离子放在你要算的体系旁边比较远的位置。如果你要算的体系里有可以与金属离子配位的原子，可以把金属离子放在那些原子附近。然后做结构优化

作者
Author: WMQueen 时间: 2021-5-24 20:41

wzkchem5 发表于 2021-5-24 17:33
把抗衡离子放在你要算的体系旁边比较远的位置。如果你要算的体系里有可以与金属离子配位的原子，可以把金 ...

不好意思我不太理解，请问是这样吗：金属离子和阴离子须同时考虑，但并不一定放在一起？那势能零点还是取电离后的两部分吗？为什么不是直接用整个分子计算呢？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-5-24 22:56

WMQueen 发表于 2021-5-24 13:41
不好意思我不太理解，请问是这样吗：金属离子和阴离子须同时考虑，但并不一定放在一起？那势能零点还是取 ...

我的意思是要放在一起算，但是初始结构里面阴阳离子放得远一些。势能零点按在一起算

作者
Author: WMQueen 时间: 2021-6-22 21:06

wzkchem5 发表于 2021-5-24 22:56
我的意思是要放在一起算，但是初始结构里面阴阳离子放得远一些。势能零点按在一起算

您好，不好意思打扰了，这个问题我还想再追问一下，请问初始结构里面必须要将阴阳离子放得远一些吗，因为我算的体系当中，阳离子和反应物配位虽能抵消一部分盐电离的能量，但能量还是会上升十几千卡，导致后续的过渡态能量比较高，这种情况阴阳离子是不是不应该分开呀？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-6-22 22:59

WMQueen 发表于 2021-6-22 14:06
您好，不好意思打扰了，这个问题我还想再追问一下，请问初始结构里面必须要将阴阳离子放得远一些吗，因为 ...

我的意思是，结构优化的初猜结构放得远一些，结构优化过程中两者会自动靠近。
之所以初猜结构要放得远一些，是因为有时候阴阳离子有两种结合模式，一种是非共价结合，离得远，另一种是共价结合，离得近，类似物理吸附与化学吸附的关系。只有初始结构两个离子放得足够远，才能保证找到前者。如果放得太近，比非共价结合的结构还要近，那有可能优化到共价结合的结构，结果就不是你想要的了。

作者
Author: WMQueen 时间: 2021-6-23 11:47

wzkchem5 发表于 2021-6-22 22:59
我的意思是，结构优化的初猜结构放得远一些，结构优化过程中两者会自动靠近。
之所以初猜结构要放得远一 ...

谢谢老师，我再思考一下

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