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标题: 求助:使用grompp命令时出现如下报错应该如何解决? [打印本页]

作者
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dumsky2019928    时间: 2021-5-15 22:20
标题: 求助:使用grompp命令时出现如下报错应该如何解决?
ERROR: The cut-off length is longer than half the shortest box vector or longer than the smallest box diagonal element. Increase the box size or decrease rlist.

我用的盒子尺寸为7.5nm*7.5nm*7.5nm,gromacs的版本是2018.8,所有的输入文件均上传于附件之中。

作者
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sobereva    时间: 2021-5-17 02:52
ea.itp和no3.itp根本都不规矩,连残基名都没有
no3.itp里都没二面角项,根本没法用,平面都维持不了
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dumsky2019928    时间: 2021-5-19 04:03
sobereva 发表于 2021-5-17 02:52
ea.itp和no3.itp根本都不规矩,连残基名都没有
no3.itp里都没二面角项,根本没法用,平面都维持不了

谢谢老师!




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