计算化学公社

标题: 聚合物吸附重金属的电子密度差分析求助 [打印本页]

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wudiazhu    时间: 2021-5-15 23:12
标题: 聚合物吸附重金属的电子密度差分析求助
老师们好,我想证明一个六价的Cr(HCrO4-)在一个聚合物的羟基上得到电子被还原的过程,使用Castep作得的电子密度差如图所示,蓝色是失电子,黄色是得电子。我有几个问题,
(1)我的HCrO4-上的氧除了被大范围的蓝色覆盖,蓝色里面还有一小部分的黄色区域,这两部分是氧的p和s电子吗?
(2)我这个电子密度差的结果貌似表明,电子转移方向是从HCrO4-上的O转移到我的聚合物的OH,这是不是和化学常识违背?酚羟基应该有很强的给电子能力才对。
(3)HCrO4-中间的Cr被黄色区域覆盖,可以说明我的六价铬得到了电子并被还原吗?
感谢老师们的解答。

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作者
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wzkchem5    时间: 2021-5-15 23:54
一般而言,一个中性分子和一个阴离子放在一起,即使两者不发生化学反应,阴离子也会转移少量电子(一般远不到1个)给中性分子,使得总体系能量降低。
HCrO4-固然会接受有机分子的电子,但是因为这是一个化学反应,可能有一个非零的能垒,你如果只是简单把两者放在一起而不给它们能量,可能发生的就是我第一句话说的过程。这和化学反应是往哪边转移电子无关。
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wudiazhu    时间: 2021-5-16 00:31
wzkchem5 发表于 2021-5-15 23:54
一般而言,一个中性分子和一个阴离子放在一起,即使两者不发生化学反应,阴离子也会转移少量电子(一般远不 ...

感谢老师的回答!您的意思是我的HCrO4-从聚合物得到电子的反应并不是自发的是吗,那倘若我现在希望HCrO4-发生上述反应,需要在模拟时加一些什么条件?也就是您说的“给它们能量”这个要怎么实现呢?
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wzkchem5    时间: 2021-5-16 00:49
wudiazhu 发表于 2021-5-15 17:31
感谢老师的回答!您的意思是我的HCrO4-从聚合物得到电子的反应并不是自发的是吗,那倘若我现在希望HCrO4- ...

我想到一个问题,你的计算是broken symmetry计算吗?如果不是的话,可能问题不一定是电子转移不是自发的,而是你的计算方法根本就不允许转移一个电子。
如果你已经做了broken symmetry,仍然收敛到电子没转移的态的话,你可以优化一下三重态结构,从三重态结构出发做broken symmetry singlet优化,有一定概率能找到电子转移后的结构
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wudiazhu    时间: 2021-5-16 01:23
wzkchem5 发表于 2021-5-16 00:49
我想到一个问题,你的计算是broken symmetry计算吗?如果不是的话,可能问题不一定是电子转移不是自发的 ...

感谢老师回答。我在计算时并没有使用自旋极化,您说的“计算方法不允许转移一个电子“是因为此时α和β电子共用了一个轨道是吗,那为什么不能同时转移n个电子?
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wzkchem5    时间: 2021-5-16 16:14
wudiazhu 发表于 2021-5-15 18:23
感谢老师回答。我在计算时并没有使用自旋极化,您说的“计算方法不允许转移一个电子“是因为此时α和β电 ...

对,如果转移一个电子,必然会导致自旋极化,比如转移alpha电子,beta电子留在原位,显然得到的波函数必须是自旋极化的。
转移2个(或者2n个)电子不受不考虑自旋极化的影响,但是热力学上太困难了。




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