计算化学公社

标题: 求助:小团簇结构优化不收敛 [打印本页]

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jimulation    时间: 2021-5-20 11:53
标题: 求助:小团簇结构优化不收敛
从MD模拟轨迹中,提取出一个由Li+和3个分子(离子)配位形成的团簇结构,在opt B3LYP-D3(BJ)/TZVP下优化结构始终不收敛,改为opt=loose B3LYP-D3(BJ)/SVP,依旧不收敛,到了132步的时候报l9999错误,Number of steps exceeded。输出文件显示Force不是很大,但是Displacement一直降不下来,并且有震荡。
请大家帮忙看看,有什么方法能帮助这个团簇几何优化收敛吗?感谢

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jiangning198511    时间: 2021-5-20 13:46
你可要考虑先让部分结构优化好后,再添加一些结构
作者
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hdhxx123    时间: 2021-5-20 13:55
这样相对小的体系可以考虑calcall和recalc
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164
作者
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wzkchem5    时间: 2021-5-20 14:54
梯度接近0但是步长降不下来的情况,可以减小步长试试
作者
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jimulation    时间: 2021-5-20 18:14
hdhxx123 发表于 2021-5-20 13:55
这样相对小的体系可以考虑calcall和recalc
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.c ...

谢谢,加了recalc=3还是没能收敛...
作者
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hdhxx123    时间: 2021-5-20 18:37
jimulation 发表于 2021-5-20 18:14
谢谢,加了recalc=3还是没能收敛...

还有一些方法在博文里,都试试吧,这种情况只能耐心一个个试了
作者
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jimulation    时间: 2021-5-20 19:19
hdhxx123 发表于 2021-5-20 18:37
还有一些方法在博文里,都试试吧,这种情况只能耐心一个个试了

是的,方法比较多,正在尝试中。
作者
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jimulation    时间: 2021-5-20 21:18
wzkchem5 发表于 2021-5-20 14:54
梯度接近0但是步长降不下来的情况,可以减小步长试试

谢谢
作者
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jimulation    时间: 2021-5-20 21:20
jiangning198511 发表于 2021-5-20 13:46
你可要考虑先让部分结构优化好后,再添加一些结构

谢谢,我看博文中没有这个方法,这个在操作时有什么技巧不?
作者
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sobereva    时间: 2021-5-20 22:00
优化时候甭用SMD。用默认的IEFPCM
不要用def-SVP,一律用def2-SVP
四个硫在一起的结构非常诡异,怀疑这个模型的化学意义

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喵星大佬    时间: 2021-5-21 01:59
S4是个什么鬼。。。。你怕不是把两个S8各砍了一半。。。。
作者
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wzkchem5    时间: 2021-5-21 03:56
喵星大佬 发表于 2021-5-20 18:59
S4是个什么鬼。。。。你怕不是把两个S8各砍了一半。。。。

我看了一下楼主的输入输出文件,这个不是问题,因为总电荷是-3,说明S4是-2价离子。
比如在锂硫电池里,S8被还原成两个[S4]2-,很合理。
作者
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jimulation    时间: 2021-5-21 10:26
sobereva 发表于 2021-5-20 22:00
优化时候甭用SMD。用默认的IEFPCM
不要用def-SVP,一律用def2-SVP
四个硫在一起的结构非常诡异,怀疑这个 ...

好的,谢谢社长。S4是模拟的带2个负电的多硫离子
作者
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jimulation    时间: 2021-5-21 10:48
wzkchem5 发表于 2021-5-21 03:56
我看了一下楼主的输入输出文件,这个不是问题,因为总电荷是-3,说明S4是-2价离子。
比如在锂硫电池里, ...

是的 这个构型几何优化真是不容易收敛
作者
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wzkchem5    时间: 2021-5-21 15:43
jimulation 发表于 2021-5-21 03:48
是的 这个构型几何优化真是不容易收敛

本来溶液里面每个[S4]2-至少得有2个Li+,你抠出一个Li+和两个[S4]2-,是不是也不太符合真实情况
作者
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jimulation    时间: 2021-5-21 16:23
wzkchem5 发表于 2021-5-21 15:43
本来溶液里面每个[S4]2-至少得有2个Li+,你抠出一个Li+和两个[S4]2-,是不是也不太符合真实情况

是从MD中提取的,可能确实难以稳定存在,估计也是优化不收敛的原因




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