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标题: 求助：在VMD中如何显示特定残基中特定原子与残基之间的氢键 [打印本页]

作者
Author: Aristotler 时间: 2021-5-22 12:21
标题: 求助：在VMD中如何显示特定残基中特定原子与残基之间的氢键
请问，在VMD中，如何显示特定的残基与残基之间的氢键，如下面的模拟图中，如何显示OTf阴离子中O原子和H2O之间的氢键，而排除掉H2O和H2O之间的氢键？我已经清楚H2O和H2O之间的氢键显示语句： resname SOL. 但显示OTf阴离子和H2O之间的氢键时，尝试 name O and resname OTf and resname SOL 不行。请各位指导。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-5-23 03:13
没有办法排除。可以考虑只把特定残基以及周围的一圈水选中（利用within），作为一个独立的rep用来显示其中的氢键

作者
Author: Aristotler 时间: 2021-5-26 16:15

sobereva 发表于 2021-5-23 03:13
没有办法排除。可以考虑只把特定残基以及周围的一圈水选中（利用within），作为一个独立的rep用来显示其中 ...

谢谢卢老师

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