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标题: gromacs拉伸模拟中，想增大输出的拉力与时间文件中的时间间隔的问题该怎么解决 [打印本页]

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Author: MrWang 时间: 2021-5-31 21:24
标题: gromacs拉伸模拟中，想增大输出的拉力与时间文件中的时间间隔的问题该怎么解决
各位大神请问一下，做完拉伸模拟之后，输出的拉力与时间文件（pullf.xvg）文件里的时间是每隔0.1秒输出一个力，，我现在想让这个数据变成每隔1秒输出一个力，对于pull.mdp文件该改哪个参数呢，我的pull.mdp文件和拉力与时间文件放在了附件里，谢谢大家

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Author: sobereva 时间: 2021-6-1 03:36
模拟总时间尺度都达不到0.1秒，怎么可能每隔0.1秒输出一次

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Author: MrWang 时间: 2021-6-1 09:45

sobereva 发表于 2021-6-1 03:36
模拟总时间尺度都达不到0.1秒，怎么可能每隔0.1秒输出一次

不好意思老师，看错了，文件里是每隔0.1Ps对应一个力，我现在想让输出的文件每隔1ps对应一个力应该改哪个参数呢，谢谢老师

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Author: sobereva 时间: 2021-6-1 10:45
自行用awk，每10行输出一次就完了。awk的用法google

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Author: lyj714 时间: 2021-6-1 11:38
本帖最后由 lyj714 于 2021-6-1 11:40 编辑

pull-nstxout
pull-nstfout
分别控制距离和力的输出频率

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Author: jiangshenda 时间: 2022-3-23 15:02
老哥，你是对小蛋白进行拉伸的吗

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