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标题: 单斜晶系切001面怎么总是切成正交的晶胞? [打印本页]

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灰飞的旋律    时间: 2021-6-1 14:51
标题: 单斜晶系切001面怎么总是切成正交的晶胞?
请教下,怎么才能让MS中切这种单斜晶系时,切出来的面加上真空层后也同样是单斜晶系,我切出来总是正交晶系。是我哪里的参数设置错了吗?谢谢
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卡开发发    时间: 2021-6-1 19:02
程序不会切那样的面,简单的做法是维持笛卡尔坐标然后拉高C轴。
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wzkchem5    时间: 2021-6-1 19:49
有真空层的体系,讨论晶系是没有意义的。
因为这个带着真空层的体系是单斜还是正交,只影响表面和它的周期镜像之间的相对位置,而不影响表面自己的原子坐标。但是表面的周期镜像本身就是在物理上不存在的,是一个artifact。纠结晶系的问题等价于纠结这个artifact是在表面的正上方还是斜上方,没有任何意义。
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灰飞的旋律    时间: 2021-6-1 21:45
wzkchem5 发表于 2021-6-1 19:49
有真空层的体系,讨论晶系是没有意义的。
因为这个带着真空层的体系是单斜还是正交,只影响表面和它的周期 ...

谢谢,我懂您的意思了,不纠结晶系的问题了现在
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灰飞的旋律    时间: 2021-6-1 21:47
卡开发发 发表于 2021-6-1 19:02
程序不会切那样的面,简单的做法是维持笛卡尔坐标然后拉高C轴。

我切001面时,您也可以看到蓝色线不和晶胞的白线重合,但我用六方晶系的晶胞切表面时,是完全重合的啊,这样不重合切出来的会不会是不合理的结构
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卡开发发    时间: 2021-6-1 23:54
灰飞的旋律 发表于 2021-6-1 21:47
我切001面时,您也可以看到蓝色线不和晶胞的白线重合,但我用六方晶系的晶胞切表面时,是完全重合的啊, ...

这个无所谓,调整下top位置应该就能重合,但是反而不是你需要的结构。蓝色的线只是提供你预览切面的方向和区域而已。




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