计算化学公社

标题: 以不同摩尔分数比进行混合的二元溶液中分子间相互作用问题的求助 [打印本页]

作者
Author: 寒心望明月 时间: 2021-6-3 14:53
标题: 以不同摩尔分数比进行混合的二元溶液中分子间相互作用问题的求助
求助各位老师，我需要用Gaussian计算一个二元溶液体系中分子间相互作用的问题，并模拟混合体系的拉曼光谱和分子间相互作用能，例如甲酸-水二元溶液，由于两种分子之间会形成氢键，对于不同摩尔分数比的情况，比如甲酸：水=9:1，8:2，7：3，...,1:9，由于两种分子数量不同，会形成不同的氢键模式，在拉曼光谱中会表现出拉曼位移的变化，并且通过拉曼光谱的变化可以分析摩尔分数变化这一过程中溶液内发生的相变。但是对这一过程进行模拟的过程中遇到了一些困难，如果对于摩尔分数比1：1的情况，构建两个分子就行了，但是按这种思路，对于9：1的情况，要构建十个分子，对于4.5：5.5的情况，要构建20个分子，这计算量就太大了，而且具体的缔合结构也不明确，在优化几何结构时总是报错，不知道是不是这种思路有问题，要处理这种摩尔分数逐渐变化的问题是否有什么更好的方式，望各位大神指点。
另外，请问Gaussia能否模拟受激拉曼散射过程，特别是模拟上述摩尔分数比变化的实验在受激拉曼散射中的现象。

作者
Author: wudiazhu 时间: 2021-6-3 15:31
这得用分子模拟吧，建不同比例混合的均相体系，最后统计氢键数目。用量化计算量大不说，初始构型也不知道怎么摆吧？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-6-4 09:08
这明显不是靠Gaussian能算的，而且这也绝对不是什么简单问题。
需要用CP2K+Travis基于从头算动力学计算溶液的拉曼光谱，但这是极为耗时的，要做好心理准备

作者
Author: 寒心望明月 时间: 2021-6-4 10:27

wudiazhu 发表于 2021-6-3 15:31
这得用分子模拟吧，建不同比例混合的均相体系，最后统计氢键数目。用量化计算量大不说，初始构型也不知道怎 ...

是的，您说的这些问题也都遇到过，也没想到什么解决办法，确实是超出了Gaussian能解决的范畴，应该需要用分子模拟的方法试试，感谢您的建议！

作者
Author: 寒心望明月 时间: 2021-6-4 10:32

sobereva 发表于 2021-6-4 09:08
这明显不是靠Gaussian能算的，而且这也绝对不是什么简单问题。
需要用CP2K+Travis基于从头算动力学计算溶 ...

请问这个极为耗时大概是多久，我目前有一台万元左右的12核小服务器可以使用，如果一次运算在几天内可以解决的话还是能接受的。
另外您提到的用从头算动力学进行计算方法能否更详细地指点一下，具体要怎么操作？
万分感谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2021-6-5 10:16

寒心望明月发表于 2021-6-4 10:32
请问这个极为耗时大概是多久，我目前有一台万元左右的12核小服务器可以使用，如果一次运算在几天内可以解 ...

几天没戏。这可不是什么小计算，你把问题想得太容易了。

作者
Author: 寒心望明月 时间: 2021-6-7 08:42

sobereva 发表于 2021-6-5 10:16
几天没戏。这可不是什么小计算，你把问题想得太容易了。

好的，感谢您的回复！

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)