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标题: 第一次自己买机器计算，大家看看配置报价合理不？ [打印本页]

作者
Author: otakuswm 时间: 2015-12-10 23:11
标题: 第一次自己买机器计算，大家看看配置报价合理不？

序号	品称	规格	数量	单价	总价
1	主板	ASUS-Z10PA-D8	1	￥2,940.00	￥2,940.00
2	内存	金士顿16G ddr4 RECC	4	￥960.00	￥3,840.00
3	硬盘	ST2000NM0033 企业	1	￥936.00	￥936.00
4	CPU	XEON-E5 2630 V3	2	￥4,780.00	￥9,560.00
5	电源	台达CAA-550ct双8P	1	￥984.00	￥984.00
6	显卡	板载	0	￥0.00	￥0.00
7	机箱	ASUS塔式机箱	1	￥900.00	￥900.00
8	光驱	DVDRW	1	￥180.00	￥180.00
9	CPU散热器	散热系统	2	￥180.00	￥360.00
10	网卡	1000M PCI-E	2	￥150.00	￥300.00

各位高手，本人虽然做了几年计算，但是对工作站这块儿是知之甚少，上面的机器配置我是不是买的稍贵了点？这台机器已经买回来组装好了，我能否在器械硬盘上安装双系统（win7和linux），办公用win7，计算用linux。还有就是能否指点下：linux安装什么版本做gaussian计算合适？针对这个配置还有什么注意事项望各位指教，看了本论坛的帖子，好多提到关闭超线程，我的要关闭超线程吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2015-12-10 23:32
主板、电源、机箱选的都偏贵。网卡其实都不用买，是集成的。

可以双系统，但如果嫌切换麻烦，用vmware装虚拟的linux会方便得多得多得多。
g09 D.01就行。
关闭超线程是计算化学界严重的以讹传讹，本论坛里也已经澄清很多次了。

作者
Author: 978142355 时间: 2015-12-11 08:14

sobereva 发表于 2015-12-10 23:32
主板、电源、机箱选的都偏贵。网卡其实都不用买，是集成的。

可以双系统，但如果嫌切换麻烦，用vmware装 ...

god，师兄昨天还和我说让我把服务器的超线程关了，因为那样会影响到高斯的并行……………………另外，sob老师，我想问一下，开机开始的时候有一个Logical，里面设置开或关对计算有什么影响？（Logical改的是不是超线程呢？师兄说那个是，然后选择了disabled）

作者
Author: otakuswm 时间: 2015-12-11 08:29

sobereva 发表于 2015-12-10 23:32
主板、电源、机箱选的都偏贵。网卡其实都不用买，是集成的。

可以双系统，但如果嫌切换麻烦，用vmware装 ...

多谢sob老师这么快回复。装虚拟的linux不会影响计算速度是吗？请问sob老师何种linux更合适g09计算？先谢谢了

作者
Author: 我本是个娃娃 时间: 2015-12-11 08:53

otakuswm 发表于 2015-12-11 08:29
多谢sob老师这么快回复。装虚拟的linux不会影响计算速度是吗？请问sob老师何种linux更合适g09计算？先谢 ...

你设置好了需要的内存和CPU核数，就没有问题，本论坛最推荐的就是红帽企业版了6.5还是7.0都行

作者
Author: root 时间: 2015-12-11 16:56

sobereva 发表于 2015-12-10 23:32
主板、电源、机箱选的都偏贵。网卡其实都不用买，是集成的。

可以双系统，但如果嫌切换麻烦，用vmware装 ...

关于超线程，我想插一句

自己用的机器，我同意你的观点，超线程不用关，多少个实际核心就提交多少个任务；

课题组公共的集群，超线程一定要关掉！
要不然各种管理软件（包括top）显示只用了50%的CPU，会被别人抢
比如并行的任务，某个人用10台计算机在一起做mpi并行，其中只要一台被别人抢了几个核，整体就会慢下来，另外9台机器的cpu也就浪费了

作者
Author: sobereva 时间: 2015-12-11 17:40

otakuswm 发表于 2015-12-11 08:29
多谢sob老师这么快回复。装虚拟的linux不会影响计算速度是吗？请问sob老师何种linux更合适g09计算？先谢 ...

我习惯用RHEL6或7。
虚拟机里跑高斯和你实际装个linux跑高斯速度几乎没差别，而且不影响你windows前台干任何事，文件互拷还很方便一拖拽就行，而且还能方便地给虚拟机做镜像以防玩坏。只要你的机子windows和linux需要同时用，就一定要装虚拟机。如果机子仅仅用于计算，就装实体linux。

作者
Author: sobereva 时间: 2015-12-11 17:42

978142355 发表于 2015-12-11 08:14
god，师兄昨天还和我说让我把服务器的超线程关了，因为那样会影响到高斯的并行……………………另外，sob ...

根本不会影响并行，都是以讹传讹，对于轻信、传播谣言也不知道自己去检验的做法我十分鄙夷。
有多少物理核心计算时就最多分配多少核心。而且即便用了超线程虚拟出的逻辑核心，往往也会有微量速度提升而不一定造成速度下降。
logical不知道你具体指什么，有个照片一看就知道了。

作者
Author: 978142355 时间: 2015-12-11 20:36

sobereva 发表于 2015-12-11 17:42
根本不会影响并行，都是以讹传讹，对于轻信、传播谣言也不知道自己去检验的做法我十分鄙夷。
有多少物 ...

哦，这样啊。不过老师我们是大型服务器，6楼说开启了，别人并行会抢了自己的核，不知是否真的如此。唉，我师兄竟然还和我说，超线程会限制多核变为单核计算，不合算，所以为了加快效率，要关了超线程。。。。。。。我还把这句话记在了本本上。。。。。关于logical的图片老师明天在论坛的这里贴出来，到时候麻烦sob老师帮忙看一眼，以正吾之视听，先谢谢sob大神。

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2015-12-11 23:14

978142355 发表于 2015-12-11 20:36
哦，这样啊。不过老师我们是大型服务器，6楼说开启了，别人并行会抢了自己的核，不知是否真的如此。唉， ...

一下讨论假设机器有8个核、最多16个逻辑线程，如果没有排队系统限制，别人又不自觉，只跑8个核心会显示50% CPU，所以就会有人上去跑；关了超线程就会显示100%，大家就知道满了。这就是个自觉问题，即使100%了也还是能接着提交。

如果有排队系统，做好配置，要求一个quene只能用8个核。这样若系统有8个核正在跑，再提交就会排队；比如正在用6个核，再提交4核任务、即使机器有16个逻辑线程也不会跑，必须等到6核任务跑完。

如果有排队系统还有这个问题那就是软件没配好。

Logical的disable应该（很可能）就是关超线程，试一下就知道了。

作者
Author: 978142355 时间: 2015-12-12 08:50

liyuanhe211 发表于 2015-12-11 23:14
一下讨论假设机器有8个核、最多16个逻辑线程，如果没有排队系统限制，别人又不自觉，只跑8个核心会显示50 ...

谢谢Li老师，您帮我看一下，这个应该是超线程吧？
这超线程和排队系统有什么关系？

作者
Author: root 时间: 2015-12-12 10:34

978142355 发表于 2015-12-12 08:50
谢谢Li老师，您帮我看一下，这个应该是超线程吧？
这超线程和排队系统有什么关系？

Logical Processor 是控制超线程的，自己用的机器没必要关掉
Logical Processor Idling 是另外一个东西，一般默认是关的，Dell官方文档上说老的Linux内核开这个选项会出问题，我没测试过

作者
Author: 978142355 时间: 2015-12-12 14:58

root 发表于 2015-12-12 10:34
Logical Processor 是控制超线程的，自己用的机器没必要关掉
Logical Processor Idling 是另外一个东西 ...

那集群服务器的关掉可不可以呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2015-12-12 18:37

978142355 发表于 2015-12-12 14:58
那集群服务器的关掉可不可以呢？

不要关。
和组里的人打好招呼，让人人知道有多少物理核心。

作者
Author: 978142355 时间: 2015-12-12 19:27

sobereva 发表于 2015-12-12 18:37
不要关。
和组里的人打好招呼，让人人知道有多少物理核心。

懂了，理由前面的我都看过了，再次谢谢大家。我就算排除万难也得和组里的人讲清楚，如果他们都还不信，我就真做测试让他们信了为止。感谢大家。

作者
Author: otakuswm 时间: 2015-12-14 09:10

sobereva 发表于 2015-12-11 17:40
我习惯用RHEL6或7。
虚拟机里跑高斯和你实际装个linux跑高斯速度几乎没差别，而且不影响你windows前台 ...

感谢sob大神！我明白了，我试着装一下。谢谢指点！自己继续提高，多来论坛见识一下。

作者
Author: otakuswm 时间: 2015-12-14 09:10

liyuanhe211 发表于 2015-12-11 23:14
一下讨论假设机器有8个核、最多16个逻辑线程，如果没有排队系统限制，别人又不自觉，只跑8个核心会显示50 ...

谢谢高手指点迷津

作者
Author: otakuswm 时间: 2015-12-20 16:54

sobereva 发表于 2015-12-11 17:40
我习惯用RHEL6或7。
虚拟机里跑高斯和你实际装个linux跑高斯速度几乎没差别，而且不影响你windows前台 ...

sob老师，按照您的指点，我安装了虚拟机，安装了RHEL6，现在高斯也安装好了，已经可以算了，十分感谢。现在还有个小问题请教下，安装上面的配置我设置%nproc=16，虽然可以算，但是cpu占用率是1600%，者是怎么回事？会损害机器或者影响计算速度吗？

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2015-12-20 17:00

otakuswm 发表于 2015-12-20 16:54
sob老师，按照您的指点，我安装了虚拟机，安装了RHEL6，现在高斯也安装好了，已经可以算了，十分感谢。现 ...

就是16个逻辑处理器都用了100%，正常

作者
Author: otakuswm 时间: 2015-12-20 23:00

liyuanhe211 发表于 2015-12-20 17:00
就是16个逻辑处理器都用了100%，正常

多谢大侠指点

作者
Author: lao7 时间: 2015-12-27 14:05
不如自己买，自己配，虽然表面上看每一件似乎合乎市场行情，但都贵了那么点，加一起就多了。举个例子：内存建议使用三星DDR4 2133 16g单根，因为它是市场上最早推出单根16G的，前天刚买过680元一根。其次，我不明白这个1000M的网卡是否要单配？因为服务器集成网卡能达到这个带宽？主板建议用超微的，好像目前还不到2500元一块。你这个ASUS-Z10PA-D8主板，目前开票价格也不到2300元，所以总体价格高了。CPU这款XEON-E5 2630 V3，3800元一枚左右。所以你这配置，如果让我自己装，同样价格能装更牛逼的。我说的都是开票价格。

作者
Author: sudao2006 时间: 2016-1-5 14:32
看看这贴子普及了很多常识：D

作者
Author: otakuswm 时间: 2016-1-18 20:20

lao7 发表于 2015-12-27 14:05
不如自己买，自己配，虽然表面上看每一件似乎合乎市场行情，但都贵了那么点，加一起就多了。举个例子：内存 ...

多谢，自己以后有经验了就自己攒机了，多谢指点

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