计算化学公社

标题: 求助：用g_mmpbsa计算结合能时极性溶剂化能太大 [打印本页]

作者
Author: 芮啦 时间: 2021-6-4 11:00
标题: 求助：用g_mmpbsa计算结合能时极性溶剂化能太大
本帖最后由芮啦于 2021-6-4 11:00 编辑

各位老师好，我现在刚开始学习使用g_mmpbsa计算结合能，但是在得到的结果中极性溶剂化能特别大，请问各位老师在计算前需要对轨迹进行特别的处理吗

我用g_mmpbsa计算一个适配体和一个金属离子的结合能，在一步计算结合能中需要输入计算参数文件，在极性溶剂化能的输入参数中有溶液中的正负电荷，正负电荷离子的半径，正负电荷离子的浓度等。我的体系中带正电荷的离子不止一种，所以在此想请教各位老师，在输入参数中的正电荷离子半径应该怎么填呢，可以直接使用官网提供的参数文件吗

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)