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标题: polyrate输入文件.fu40的VVALUE参数设置求助 [打印本页]

作者
Author: 黯殇666 时间: 2021-6-7 20:09
标题: polyrate输入文件.fu40的VVALUE参数设置求助
请问各位老师们，polyrate的输入文件.fu40中的VVALUE参数的值是用吉布斯自由能呢还是用电子能量呢，手册中只说 it specifies the value of the potential at the reactant, product or saddle point. 多谢

作者
Author: bxpu 时间: 2022-5-24 10:22
你好，你的问题解决了吗？我这段时间也在写polyrate 的输入文件我想问一下.fu40中的HESSIAN, SMEP, GEMO，GRAD,是从哪里可以获取的呢？

作者
Author: 黯殇666 时间: 2022-6-28 10:24
提供一下我的做法，以供参考讨论
1. 可以详细地看一下Polyrate的手册，关于参数的含义有解释，如图1。
2. SMEP和VMEP可以看做确定一个点的位置所需要的两个坐标，一个是反应坐标SMEP，一个是能量坐标VMEP。SMEP我是通过IRC曲线上的横坐标值确定的，如图2所示；对于VEMP而言，我是将反应物的能量看作0，求IRC上选取的点和反应物的能量差，这个差就是VEMP。
3. GEOM是坐标，很简单。HESSIAN和GRAD是从频率分析后的.fchk文件文件中获取的，如图3。
4. 关于Polyrate，我也不是特别了解，因为之前的研究，仅仅了解一点点，如果要深入，一定要多看手册关于输入文件部分的介绍。

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