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标题: 急求一种能分析估计蛋白受体配体结合前后的残基贡献 [打印本页]

作者
Author: chenxianzhao 时间: 2021-6-8 15:30
标题: 急求一种能分析估计蛋白受体配体结合前后的残基贡献
受体蛋白表面上有两个离得较近的带相反电荷的残基对，当受体蛋白与配体结合后，在受体配体形成的结合界面上，这两个残基距离会靠近且形成稳定存在的盐桥。

我想要知道这两个带电残基在受体配体结合前后，从不形成盐桥到稳定形成盐桥这个变化过程对整体受体配体结合自由能所作的贡献有多少？有什么方法能实现这样的目的吗？望各位老师和同学指点

作者
Author: sobereva 时间: 2021-6-8 19:27
对两个残基侧链做不同的距离限制，看强行形成盐桥和不形成盐桥的时候算出来的结合自由能各是多少

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