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标题: molcus调用gaussian出现不执行几何优化任务问题求助 [打印本页]

作者
Author: wuyeyangguang 时间: 2021-6-17 22:25
标题: molcus调用gaussian出现不执行几何优化任务问题求助
各位大侠好，我在超算平台使用molcus调用Gaussian 16及Orca 4.2.1进行分子构象批量计算，出现如下报错：
Error: This Gaussian task did not perform geometry optimization at all! Please check if you omitted "opt" keyword or there is any problem in the template file
settings文件中itask为3，template文件中确认有opt关键词，生成的gau.gjf似乎也没有问题，而gau.out文件无任何信息，为0字节文件。
仔细浏览过论坛中的相关帖子，还是没有找到问题所在。附上相关文件，求大侠指点，谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2021-6-18 01:23
molclus必须能直接通过g16命令调用Gaussian才能计算，你得确保你当前的实际运行环境满足这点

作者
Author: wuyeyangguang 时间: 2021-6-18 11:09

sobereva 发表于 2021-6-18 01:23
molclus必须能直接通过g16命令调用Gaussian才能计算，你得确保你当前的实际运行环境满足这点

谢谢社长。我先确认了Gaussian本身是能够直接用的，然后将settings文件中Gaussian_path写成Gaussian安装绝对目录也还是同样问题。

作者
Author: reddy 时间: 2021-6-18 16:31
我也是同样问题，环境变量也改了很多次了，一直都不行

作者
Author: snljty 时间: 2021-6-18 16:42

reddy 发表于 2021-6-18 16:31
我也是同样问题，环境变量也改了很多次了，一直都不行

这和楼主的不一样，这明显是GAUSS_EXEDIR设错了。GAUSS_EXEDIR都叫DIR了应该是个directory。改成C:\G09W

作者
Author: reddy 时间: 2021-6-18 17:16
本帖最后由 reddy 于 2021-6-18 17:18 编辑

snljty 发表于 2021-6-18 16:42
这和楼主的不一样，这明显是GAUSS_EXEDIR设错了。GAUSS_EXEDIR都叫DIR了应该是个directory。改成C:\G09W

谢谢大佬的解答，我看error一样就以为是一样的问题呢，实在不好意思我可不可以在追问一下，就是我改了之后还是出错不知道该如何解决

作者
Author: snljty 时间: 2021-6-18 17:24

reddy 发表于 2021-6-18 17:16
谢谢大佬的解答，我看error一样就以为是一样的问题呢，实在不好意思我可不可以在追问一下，就是我改了之 ...

是不是有什么程序在占用着gau.gjf？关闭所有可能占用的程序并重试，如果不确定就重启电脑试试。

作者
Author: reddy 时间: 2021-6-18 20:50

snljty 发表于 2021-6-18 17:24
是不是有什么程序在占用着gau.gjf？关闭所有可能占用的程序并重试，如果不确定就重启电脑试试。

非常非常感谢，感觉还是有问题

作者
Author: sobereva 时间: 2021-6-19 00:08

reddy 发表于 2021-6-18 20:50
非常非常感谢，感觉还是有问题

明明正在算着

作者
Author: winnerwill 时间: 2021-6-19 00:17
看超算的脚本，明明是Linux系统，为啥调用的是Windows的G09？

作者
Author: reddy 时间: 2021-6-19 08:45

sobereva 发表于 2021-6-19 00:08
明明正在算着

谢谢老师，可算是把这个问题解决了，真的是非常感谢了

作者
Author: wuyeyangguang 时间: 2021-6-19 10:55

winnerwill 发表于 2021-6-19 00:17
看超算的脚本，明明是Linux系统，为啥调用的是Windows的G09？

没明白什么意思，请指教

作者
Author: winnerwill 时间: 2021-6-19 14:48
本帖最后由 winnerwill 于 2021-6-19 22:28 编辑

wuyeyangguang 发表于 2021-6-19 10:55
没明白什么意思，请指教

眼花把你们两层楼的信息看成一个人的了。
你的应该设好Linux下运行G16的环境变量。

写过一个脚本，你可以试试http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 9&fromuid=19562

作者
Author: snljty 时间: 2021-6-19 16:14

reddy 发表于 2021-6-18 20:50
非常非常感谢，感觉还是有问题

那个“找不到”不用管，如果你用过cmd，删除不存在的文件时候就会报错。这里只是用来删除可能存在的之前残留的文件，避免干扰判断哪些是这次的数据的。

作者
Author: reddy 时间: 2021-6-21 09:31

snljty 发表于 2021-6-19 16:14
那个“找不到”不用管，如果你用过cmd，删除不存在的文件时候就会报错。这里只是用来删除可能存在的之前 ...

嗯嗯，谢谢老师的耐心指导

作者
Author: zhouwenhao 时间: 2021-8-17 15:11
大佬们，我也遇到相同的问题了。Molclus调用Gaussian闪退，然后生成一个空的isomer文件，gau文件只有第一个构象的坐标，setting和环境变量都改过了，是我哪里改的不对吗？

作者
Author: snljty 时间: 2021-8-17 15:19

zhouwenhao 发表于 2021-8-17 15:11
大佬们，我也遇到相同的问题了。Molclus调用Gaussian闪退，然后生成一个空的isomer文件，gau文件只有第一个 ...

如果你的GAUSS_EXEDIR是正确的，那么下面settings.ini里的gaussian_PATH应该是“F:\G09W\g09.exe”或者“F:\G09W\g09”（如果你不知道为什么后者可以，那么就用前者。）

作者
Author: zhouwenhao 时间: 2021-8-17 16:32

snljty 发表于 2021-8-17 15:19
如果你的GAUSS_EXEDIR是正确的，那么下面settings.ini里的gaussian_PATH应该是“F:\G09W\g09.exe”或者“ ...

大佬，你可太及时了

；我这个是在运行中吧，下次运行图中的文件是不是自动覆盖了

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