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标题: 求助高斯频率分析Coord Atom Element下面的数据是什么意思 [打印本页]

作者
Author: 任嘉人amber 时间: 2021-6-17 22:52
标题: 求助高斯频率分析Coord Atom Element下面的数据是什么意思
新手求助，各位老师好，图片中的这个Coord Atom Element下面的数据是什么意思呀~谢谢老师了

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-6-17 23:27
coord 1=x, 2=y, 3=z
atom就是原子编号
element是原子序数，比如6就代表碳

作者
Author: 任嘉人amber 时间: 2021-6-17 23:34

wzkchem5 发表于 2021-6-17 23:27
coord 1=x, 2=y, 3=z
atom就是原子编号
element是原子序数，比如6就代表碳

可能是我没表述清楚，我想知道这个深层含义，是不是代表Hessian矩阵的本征向量矩阵呢，因为我想将笛卡尔坐标转化为简正坐标改如何转化呢

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-6-17 23:36

任嘉人amber 发表于 2021-6-17 16:34
可能是我没表述清楚，我想知道这个深层含义，是不是代表Hessian矩阵的本征向量矩阵呢，因为我想将笛卡尔 ...

抱歉我没看到你问的是这行字“下面”的数据是什么意思。
是mass-weighted Hessian的本征矢。不过建议从fchk里读取本征矢数据，那里读到的有效数字位数比较多

作者
Author: 任嘉人amber 时间: 2021-6-17 23:41

wzkchem5 发表于 2021-6-17 23:36
抱歉我没看到你问的是这行字“下面”的数据是什么意思。
是mass-weighted Hessian的本征矢。不过建议从f ...

哇，谢谢啦，那我还想问一个问题就是这个本征矢有单位么

作者
Author: sobereva 时间: 2021-6-18 01:21
利用这里面的代码可以基于fch里的Hessian计算本征矢
基于fch中的Hessian矩阵计算振动频率的简单程序Hess2freq
http://sobereva.com/328（http://bbs.keinsci.com/thread-3368-1-1.html）

没有单位

作者
Author: 任嘉人amber 时间: 2021-6-18 09:45

sobereva 发表于 2021-6-18 01:21
利用这里面的代码可以基于fch里的Hessian计算本征矢
基于fch中的Hessian矩阵计算振动频率的简单程序Hess2f ...

谢谢老师

作者
Author: 任嘉人amber 时间: 2021-6-18 11:12

sobereva 发表于 2021-6-18 01:21
利用这里面的代码可以基于fch里的Hessian计算本征矢
基于fch中的Hessian矩阵计算振动频率的简单程序Hess2f ...

老师我还有一个问题，就是我已经用这个质量加权的hessian矩阵将笛卡尔坐标下两个电子态的位移，也就是△Q的平方，我看这个计算黄昆因子的公式是s=（w/2h）*△Q2，如图所示，如果△Q是无量纲的话，那黄昆因子就有单位了是J/s2，请问一下这个单位我该如何转化呢。

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