计算化学公社

标题: GMX中跑复合物时配体电离的问题 [打印本页]

作者
Author: 黄舒伟 时间: 2021-6-18 17:33
标题: GMX中跑复合物时配体电离的问题
请问处理配体电离的时候，对于类似这个分子

是应该处理成这种情况么：

也就是把两端都电离，对于cooh的话就是少一个h，对于NH2就是多一个H（净电荷还是零）?然后把这个和受体组合起来去做动力学模拟么？还是说我的理解有问题呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-6-18 18:45
就是这样

羧基那边叫质子解离，NH2那边叫质子化。不叫电离

作者
Author: 黄舒伟 时间: 2021-6-18 20:07
好的，谢谢社长指正。

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