计算化学公社

标题: 离子液体催化体系的弥散函数该怎么加？ [打印本页]

作者
Author: yaoyuan0711 时间: 2021-6-20 12:35
标题: 离子液体催化体系的弥散函数该怎么加？
请教各位老师，我计算的是离子液体催化中性有机分子的反应，一共有62个原子，计算用自建的集群（并行8核），用Gaussian M062X/6-31g** em=gd3优化了4天左右才算完（计算速度太慢）。然后我用ORCA B97-3c预优化一下，然后再用Gaussian M062X/6-31g** em=gd3优化，大概1天能优化完。但是之前没有加弥散函数，而加弥散函数会大大增加计算时间。
我需要计算的是反应过程能量变化以及离子液体与有机分子之间的相互作用，结构优化的时候基组改用加弥散的2-zeta 6-31+g*好还是不加弥散的3-zeta 6-311g**？还是说现在用的6-31g**也还能接受？另外单点能计算，我是打算用M062X/ma-def2-TZVP。

请各位老师赐教，谢谢！

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-6-20 15:14
只对那些带显著负电荷的原子加弥散就行了，比如如果你的离子液体阴离子是BF4-，对F加弥散；如果阴离子是NTf2-，对N、O加弥散。这样你加弥散的原子只占原子总数的很小一部分，用3-zeta也可以算得动

作者
Author: yaoyuan0711 时间: 2021-6-20 17:35

wzkchem5 发表于 2021-6-20 15:14
只对那些带显著负电荷的原子加弥散就行了，比如如果你的离子液体阴离子是BF4-，对F加弥散；如果阴离子是NTf ...

谢谢指导。还有个问题，NTF2-中不应该是N显著带负电荷吗，为什么O也要加上弥散？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-6-20 17:58

yaoyuan0711 发表于 2021-6-20 10:35
谢谢指导。还有个问题，NTF2-中不应该是N显著带负电荷吗，为什么O也要加上弥散？

N的负电荷可以共振到O上。不过毕竟共振的比较少，所以O上不加弥散可能也是可以的。如果是我的话，保险起见O上我也会加

作者
Author: yaoyuan0711 时间: 2021-6-20 18:13

wzkchem5 发表于 2021-6-20 17:58
N的负电荷可以共振到O上。不过毕竟共振的比较少，所以O上不加弥散可能也是可以的。如果是我的话，保险起 ...

好的，谢谢您了

作者
Author: sobereva 时间: 2021-6-20 18:13
你这体系已经算挺小的了，阴离子部分全都加弥散用6-31+G**，阳离子部分6-31G**
opt freq用B3LYP-D3(BJ)，比M06-2X快不少，而且可以用更便宜的积分格点

作者
Author: yaoyuan0711 时间: 2021-6-20 18:30

sobereva 发表于 2021-6-20 18:13
你这体系已经算挺小的了，阴离子部分全都加弥散用6-31+G**，阳离子部分6-31G**
opt freq用B3LYP-D3(BJ)， ...

可能是机器比较老，算的很慢。优化用B3LYP的话，单点能用M062X，这样换泛函好吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-6-20 18:32

yaoyuan0711 发表于 2021-6-20 18:30
可能是机器比较老，算的很慢。优化用B3LYP的话，单点能用M062X，这样换泛函好吗？

再正常不过
量子化学研究中切换泛函应当注意的问题
http://sobereva.com/415（http://bbs.keinsci.com/thread-9878-1-1.html）

作者
Author: yaoyuan0711 时间: 2021-6-20 18:38

sobereva 发表于 2021-6-20 18:32
再正常不过
量子化学研究中切换泛函应当注意的问题
http://sobereva.com/415（http://bbs.keinsci.com/ ...

好的，谢谢您！

作者
Author: 一条君 时间: 2022-8-4 11:13
本帖最后由一条君于 2022-8-4 11:30 编辑

sobereva 发表于 2021-6-20 18:13
你这体系已经算挺小的了，阴离子部分全都加弥散用6-31+G**，阳离子部分6-31G**
opt freq用B3LYP-D3(BJ)， ...

老师，中性/阳离子A不加弥散,阴离子B加弥散，请问组合AB是组合所有原子加弥散（用一个基组），还是用混合基组仅对B加弥散呀，还是两种都可以，谢谢老师（之前忘记混合基组了，都是按AB用一个基组加弥散处理的）

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-8-4 15:12

一条君发表于 2022-8-4 04:13
老师，中性/阳离子A不加弥散,阴离子B加弥散，请问组合AB是组合所有原子加弥散（用一个基组），还是用混合 ...

一般来说，最好的是对B里面带显著负电的原子加弥散，次好的是对B里的所有原子加弥散，再次是对A和B的所有原子都加弥散。但三种做法都是对的，至少如果你没有遇到基组线性相关问题的话是对的。
例外情况是假如阳离子上有一个原子在后续反应里会显著带负电，那需要加弥散。比如离子液体的阳离子上有一个羟基，后续反应里会脱质子变成氧负离子，那这个羟基氧需要加弥散。

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