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标题: 绘制径向分布函数出现问题 [打印本页]

作者
Author: 二饼妹 时间: 2021-6-21 16:56
标题: 绘制径向分布函数出现问题
已经跑完10ns的NPT，想要绘制径向分布函数，输入命令：
gmx rdf -f npt.xtc -s npt.tpr -ref "name Cl" -sel "name H16"，
回车之后没有统计，直接显示了：Analyzed topology coordinates
请问这是什么情况呢？之后显示的rdf.xvg图如下，看起来似乎也不太正常

作者
Author: 二饼妹 时间: 2021-6-22 11:07
我又在另一台电脑上试了一下，画出的图如下，最后一小段都会有向下的趋势，按理说不是应该一直是1 么？我试了一下模拟的每一个体系，rdf图最后那一段都是这样，

这是怎么回事啊，求各位老师解答一下

作者
Author: sobereva 时间: 2021-6-23 00:39
统计到那么远距离根本没意义，gmx rdf默认上限太大
撑死了统计2nm也足够了

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