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标题: 求问Gaussian中ADMP关键词计算未完成时终止计算，换用服务器之前跑过的步数还会有么 [打印本页]

作者
Author: zongxh862 时间: 2021-6-22 20:42
标题: 求问Gaussian中ADMP关键词计算未完成时终止计算，换用服务器之前跑过的步数还会有么
本帖最后由 zongxh862 于 2021-6-23 10:52 编辑

求问大神！Gaussian中ADMP关键词计算未完成时终止计算（想换更快的节点计算），【记为文件1】；换用服务器继续之前的结构进行admp,【记为文件2】
ps：换用服务器之后的输入文件，是读取之前未完成任务的.chk文件

具体问题：
①想用最终得到的【文件2】结果文件，用VMD查看路径，观察分子动力学情况【请问换服务器之前，文件1跑过的步数还存在么？跑过的路径还会在结果文件2中出现么？e.g.前4ps的路径轨迹
②如果【文件2】不能满足对【文件1】路径的有效继续，那么后续该如何操作将【文件1】与【文件2】的结果轨迹情况汇聚到一起，形成连贯的路径呈现。因现计算条件有限，无法进行多步的实践演示，且少步骤的呈现并不明显。特求各位前辈老师传授经验！！！感谢！！！ *没有弄清楚换行的按键，排版粗糙请见谅

作者
Author: sobereva 时间: 2021-6-23 00:23
读起来费劲死了
论坛编辑器都是所见即所得的，怎么会搞成这样
搞不清楚就进入编辑器的纯文本模式编辑

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-6-23 00:33
你实际跑一遍就知道了
用一个简单的分子，跑2步，杀掉，从最后一步的结构开始再跑两步，然后看一下第一个结构还有没有

作者
Author: sobereva 时间: 2021-6-23 03:21
ADMP里写restart可以基于之前的chk续算
out里只有续算出来的部分，打开chk才能看完整的轨迹

作者
Author: zongxh862 时间: 2021-6-23 10:25

sobereva 发表于 2021-6-23 00:23
读起来费劲死了
论坛编辑器都是所见即所得的，怎么会搞成这样
搞不清楚就进入编辑器的纯文本模式编辑

实在不好意思老师下次进入纯文本模式编辑

作者
Author: zongxh862 时间: 2021-6-23 10:27

wzkchem5 发表于 2021-6-23 00:33
你实际跑一遍就知道了
用一个简单的分子，跑2步，杀掉，从最后一步的结构开始再跑两步，然后看一下第一个 ...

特别感谢您，服务器闲置出来，我打算这样试试。因为还想问另外一个问题，并得到权威答案，所以特发此帖

作者
Author: zongxh862 时间: 2021-6-23 10:51

sobereva 发表于 2021-6-23 03:21
ADMP里写restart可以基于之前的chk续算
out里只有续算出来的部分，打开chk才能看完整的轨迹

特别感谢老师的耐心解答！
有关于Restart关键词“Restart：Restart an ADMP calculation from the checkpoint file. Note that options set in the original job will continue to be in effect and cannot be modified.”，
想请问老师命令行具体内容应编辑什么？应选用以下哪种编辑情况？
①#p b3lyp/6-31g(d) admp restart (maxpoints=100000) 【用得到的文件1得到.gjf输入文件，直接加上“restart”】
②#p b3lyp/6-31g(d) admp restart (maxpoints=100000) geom=check guess=read【读取文件1.chk文件】
③还是说以上两种命令行有错误等问题，应是其他命令内容

求老师指导！

作者
Author: sobereva 时间: 2021-6-23 17:02

zongxh862 发表于 2021-6-23 10:51
特别感谢老师的耐心解答！
有关于Restart关键词“Restart：Restart an ADMP calculation from the check ...

格式明显错误
restart要写在ADMP(...)里

作者
Author: zongxh862 时间: 2021-6-24 20:48

sobereva 发表于 2021-6-23 17:02
格式明显错误
restart要写在ADMP(...)里

非常感谢老师的指导。
#p b3lyp/6-31g(d) admp (restart，maxpoints=100000) geom=check guess=read 已正常运行。

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