计算化学公社

标题: 求助 编译cp2k过程SIRIUS 报错 [打印本页]

作者
Author:
萧瑟    时间: 2021-6-23 12:38
标题: 求助 编译cp2k过程SIRIUS 报错
本帖最后由 萧瑟 于 2021-6-23 13:16 编辑

因为服务器有点问题  不能连外网,所以都是自己在电脑上一个包一个包的下载安装的,现在这个问题不知道该怎么解决了。求助各位大佬了

作者
Author:
abin    时间: 2021-6-23 12:54
如有机器root权限,
可以联系我。
我有解决方案。

如无root权限,请忽略以上信息。

联系方式看签名。
作者
Author:
k64_cc    时间: 2021-6-23 15:05
可以选择不用SIRIUS,平面波计算用QE就好了。
作者
Author:
leeru    时间: 2021-6-23 15:13
cp2k核心优势就在于高斯平面波基组 如果纯平面波计算,QE或者vasp或许是更好的选择,
作者
Author:
萧瑟    时间: 2021-6-23 16:11
k64_cc 发表于 2021-6-23 15:05
可以选择不用SIRIUS,平面波计算用QE就好了。

了解了  没有装sirius了
作者
Author:
萧瑟    时间: 2021-6-23 16:11
leeru 发表于 2021-6-23 15:13
cp2k核心优势就在于高斯平面波基组 如果纯平面波计算,QE或者vasp或许是更好的选择,

好的  谢谢
作者
Author:
highlight    时间: 2021-6-23 16:35
  1. -- Found GSL: /usr/local/include (found version "2.7")
  2. CMake Error at /usr/local/share/cmake-3.20/Modules/FindPackageHandleStandardArgs.cmake:230 (message):
  3.   Could NOT find PkgConfig (missing: PKG_CONFIG_EXECUTABLE)
复制代码

应该是你系统的 gsl 不合适,加上 --with-gsl=install 试试
作者
Author:
萧瑟    时间: 2021-6-23 18:53
highlight 发表于 2021-6-23 16:35
应该是你系统的 gsl 不合适,加上 --with-gsl=install 试试

大佬说这个库 在cp2k里基本用不到  所以我就没装了  然后就编译完了

作者
Author:
highlight    时间: 2021-6-24 09:22
萧瑟 发表于 2021-6-23 18:53
大佬说这个库 在cp2k里基本用不到  所以我就没装了  然后就编译完了
  1.   --with-gsl              Enable the gnu scientific library (required for PLUMED and SIRIUS)
  2.                           Default = install
复制代码

不是因为没有装,而是你的系统环境里恰好有一个不适合 SIRIUS 的版本,所以才报错
作者
Author:
萧瑟    时间: 2021-6-24 10:26
highlight 发表于 2021-6-24 09:22
不是因为没有装,而是你的系统环境里恰好有一个不适合 SIRIUS 的版本,所以才报错

非常感谢回复    这个服务器不是我自己的组里的   借用其他老师的  已经编译完成可以计算了就够用了
作者
Author:
ShuaiCui    时间: 2021-8-28 14:45
highlight 发表于 2021-6-23 16:35
应该是你系统的 gsl 不合适,加上 --with-gsl=install 试试

我装上gsl,为什么还是报错?
作者
Author:
highlight    时间: 2021-8-30 09:04
ShuaiCui 发表于 2021-8-28 14:45
我装上gsl,为什么还是报错?

需要根据实际报错内容推测原因




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3