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标题: CP2K计算QMMM时提示QM区错误 [打印本页]

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马博士    时间: 2021-6-24 08:56
标题: CP2K计算QMMM时提示QM区错误
在用CP2K计算QMMM时,提交正常计算,但是在计算一段时间后,就提示QM/MM QM atoms must be fully contained in the same image of the QM box - No wrapping of coordinates is allowed! QM区Cell设置大小和MM区一样大,也增加了QM区和MM区原子之间的LJ势,但是依旧出现这个错误。附件是提交文件以及报错信息。请大家帮忙看看是什么原因造成的
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chenjinfeng850    时间: 2021-6-25 16:43
感觉像是Z 方向上水太少了造成的,把Z方向上水层加厚
或者你把PBC去掉试一试
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马博士    时间: 2021-6-26 08:44
chenjinfeng850 发表于 2021-6-25 16:43
感觉像是Z 方向上水太少了造成的,把Z方向上水层加厚
或者你把PBC去掉试一试

好的,我试一下,非常感谢
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函数与激情    时间: 2021-7-31 08:42
Hello, the error in not the the molecule has left the box but that the molecule has separated into parts separated by more than a box (i.e. exploded). This probabably means some bad parameters in your setup.

Matt
引自 https://groups.google.com/g/cp2k/c/F86XGaqSCeE

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elpa    时间: 2021-8-14 22:05
应该是WALLS的问题,那个QUADRATIC墙到底是什么意思?作用方式是什么?
墙换成REFLECTIVE就不报这个错误了。
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elpa    时间: 2021-8-30 17:19
elpa 发表于 2021-8-14 22:05
应该是WALLS的问题,那个QUADRATIC墙到底是什么意思?作用方式是什么?
墙换成REFLECTIVE就不报这个错误了 ...

不是墙的问题,换了墙有时候还会遇到。可能就是谷歌group里说的,分子被分到了两个盒子




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