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标题: VMD如何调整蛋白透明度 [打印本页]

作者
Author: 蓝沐轩_lemshine 时间: 2021-6-26 12:02
标题: VMD如何调整蛋白透明度
本帖最后由蓝沐轩_lemshine 于 2021-6-26 15:47 编辑

大家好麻烦请教一下大家在VMD中如何只调整蛋白的透明度，而配体的透明度不变，谢谢大家

作者
Author: exity 时间: 2021-6-26 18:16
多建几个rep，材质选透明即可。话说这种事情用pymol和chimeraX可能对新手更友好

作者
Author: 蓝沐轩_lemshine 时间: 2021-6-26 21:24

exity 发表于 2021-6-26 18:16
多建几个rep，材质选透明即可。话说这种事情用pymol和chimeraX可能对新手更友好

谢谢您的解答，上图就是我用pymol做的然后最近在使用vmd 就想知道vmd达到这种效果应该怎么去操作

作者
Author: sobereva 时间: 2021-6-26 22:25
把原先的rep的选择区域设成not protein，再建立个新的rep选区设protein，Material设transparent。如果嫌透明度不理想，去Graphics - Materials里修改Transparent材质的具体定义

作者
Author: 蓝沐轩_lemshine 时间: 2021-6-28 08:56

sobereva 发表于 2021-6-26 22:25
把原先的rep的选择区域设成not protein，再建立个新的rep选区设protein，Material设transparent。如果嫌透 ...

谢谢sob老师

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