计算化学公社

标题: 求助如何分析界面上水分子的偶极取向 [打印本页]

作者
Author: ymsw_zzw 时间: 2021-6-26 18:01
标题: 求助如何分析界面上水分子的偶极取向
请教一下各位大佬。我是用lammps模拟了一个氧化镁壁面上水分子的润湿过程（如图一）。现在我想求水分子的偶极与壁面法相所成的夹角（如图二）。以此来作图三或者图四这样的图。请求各位做过类似工作的大佬给一个类似的脚本，或者有没有编程大佬能帮助我写一个后处理脚本。感激不尽，有偿也可以。

作者
Author: LSY0202 时间: 2021-6-27 09:02
震惊、。。。。。我也要算分子取向。。。。。。。。。

作者
Author: lyj714 时间: 2021-6-27 12:48
这个算是比较简单的编程了，你可以网盘发一段成品xyz轨迹上来我测试一下，我以前写过计算有序参数也就是3/2cosθ^2-0.5的那种，我测试下看是否正确，正确的话我可以提供给你。

作者
Author: ymsw_zzw 时间: 2021-6-28 10:30

lyj714 发表于 2021-6-27 12:48
这个算是比较简单的编程了，你可以网盘发一段成品xyz轨迹上来我测试一下，我以前写过计算有序参数也就是3/2 ...

非常感谢您。我把相关的轨迹文件打包放在了百度网盘里，您可以下下来试试。链接：https://pan.baidu.com/s/1R2RpCLSEfzuUgVWQ8W2isg
提取码：m7p2

您可以加我微信，微信号：ymswDezzw

作者
Author: ymsw_zzw 时间: 2021-7-3 10:40
自问自答一下，我自己写好了这一脚本文件。所以不再需要了，谢谢。

作者
Author: 大石头 时间: 2021-7-22 22:59
楼主您好，请问可以分享一下代码吗

作者
Author: ymsw_zzw 时间: 2021-8-25 15:20

大石头发表于 2021-7-22 22:59
楼主您好，请问可以分享一下代码吗

你好，还需要的话可以加我微信。微信号ymswDezzw

作者
Author: Wangzq 时间: 2022-1-4 22:20
您好，我想学习一下您算水的偶极取向的程序，发现您的微信号变了，可否告诉我一下

作者
Author: WB1040720479 时间: 2022-2-11 21:17

大石头发表于 2021-7-22 22:59
楼主您好，请问可以分享一下代码吗

您好，我也想学习这个代码，可以分享一下嘛

作者
Author: WB1040720479 时间: 2022-2-11 21:17

ymsw_zzw 发表于 2021-8-25 15:20
你好，还需要的话可以加我微信。微信号ymswDezzw

楼主请问咋联系你呀？

作者
Author: ZHTao 时间: 2022-9-18 20:30
怎么联系

作者
Author: 喜欢大海 时间: 2023-4-26 10:16
楼主你好，我也要算取向，请问能看一下你的代码吗，我自己的代码出来的结果很奇怪，想参考一下

作者
Author: Lacrimosa 时间: 2023-4-26 13:11
轨迹转成gro文件做个gmx h2order试试？

作者
Author: 活性炭 时间: 2023-6-14 14:49

ymsw_zzw 发表于 2021-7-3 10:40
自问自答一下，我自己写好了这一脚本文件。所以不再需要了，谢谢。

您好，我最近也在做类似的工作，方便提供一下您的脚本思路么？多谢！

作者
Author: mm0317ky 时间: 2023-10-24 14:58
本帖最后由 mm0317ky 于 2024-5-13 13:13 编辑

ymsw_zzw 发表于 2021-7-3 10:40
自问自答一下，我自己写好了这一脚本文件。所以不再需要了，谢谢。

作者
Author: SSFF 时间: 2024-5-9 09:17

ymsw_zzw 发表于 2021-7-3 10:40
自问自答一下，我自己写好了这一脚本文件。所以不再需要了，谢谢。

楼主，我最近也想做个这个分析，请问可以分享一下脚本吗？有偿，谢谢

作者
Author: cupb_co2 时间: 2025-3-16 13:53
楼主后处理代码还可以分享嘛

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