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标题: 求助：如何根据类药五原则对化合物库进行初筛，缩小虚拟筛选范围？ [打印本页]

作者
Author: 沐雨书生 时间: 2021-6-28 01:36
标题: 求助：如何根据类药五原则对化合物库进行初筛，缩小虚拟筛选范围？
zinc上天然产物库有十几万个小分子，直接用来进行基于靶标的虚拟筛选，得到的很多打分很高的化合物，但是很多不具有成药性，不便用作先导结构进行药物设计，一个小分子药物中要考虑以下性质：分子量、.氢键给体数目、氢键受体数目、脂水分配系数、可旋转键的数量。有没有软件可以对化合物这些性质进行快速分析并可以调用，对化合物库进行初步筛选？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-6-28 07:04
有很多免费的计算分子描述符的工具，其中就包括你说的这些，比如https://en.wikipedia.org/wiki/Molecular_descriptor里列举的几个程序

作者
Author: greatzdk 时间: 2021-6-29 17:01
用rdkit可以轻松解决这个问题，可以参考http://rdkit.chenzhaoqiang.com/basicManual.html#id36

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