计算化学公社

标题: 请教纤维素表面水分子的挥发问题 [打印本页]

作者
Author: l12332145665 时间: 2021-6-30 18:30
标题: 请教纤维素表面水分子的挥发问题
我在CHARMM36力场下，计算纤维素表面水分子薄膜（3nm）的挥发过程，体系里包含少量表面活性剂（CTAC），很奇怪的是我跑了50ns，基本没观察到水分子挥发。纤维素分三层，最下面一层固定。盒子上方有10nm的真空区。下图是NVT下跑了50ns时的结果：
[attach]36265[/attach]

附件是运行参数设置，各位老师有做过类似研究的，帮小弟看看是否参数设置有问题
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作者
Author: l12332145665 时间: 2021-6-30 18:34
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图片漏掉了，补发一下

作者
Author: sobereva 时间: 2021-7-1 04:39

l12332145665 发表于 2021-6-30 18:34
图片漏掉了，补发一下

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，这点在置顶的新社员必读贴里明确说了

作者
Author: sobereva 时间: 2021-7-1 04:42
这种带真空区的体系不要用DispCorr = Ener
我不知道你的控温组那几个都对应什么。不要把水、表面活性剂和离子作为不同的控温组对待

295K情况下能蒸发出来的水非常少，模拟很长时间才可能出来一个。你如果想看到较多水的蒸发应当尝试更高温度

作者
Author: l12332145665 时间: 2021-7-1 10:37

sobereva 发表于 2021-7-1 04:39
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，这点在置顶的新社员 ...

不好意思啊社长，我下次注意

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Author: s541040349 时间: 2022-12-27 09:33
老师请教一下你的纤维素是怎么建模的呢

作者
Author: zdworld 时间: 2023-4-23 20:38

s541040349 发表于 2022-12-27 09:33
老师请教一下你的纤维素是怎么建模的呢

这个应该是cellulose builder

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