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标题: cp2k8.1部分节点并行出错 [打印本页]

作者
Author: xiaoboy 时间: 2021-7-1 10:33
标题: cp2k8.1部分节点并行出错
各位老师和同学，按照http://sobereva.com/586群主的方法编译成功了cp2k8.1版本，用到了source /opt/intel/parallel_studio_xe_2018.0.033/bin/psxevars.sh

结果提交作业的时候只有两个节点能使用，其他节点都提示出错：
信息如下：
作业脚本文件已经加上了source /home/student/siesta/cp2k-8.1/tools/toolchain/install/setup
错误信息如下：

SCF WAVEFUNCTION OPTIMIZATION

  Step    Update method    Time Convergence       Total energy Change
  ------------------------------------------------------------------------------

*******************************************************************************
* ___                                                                      *
*  / \                                                                   *
* [ABORT]                                                                   *
*  \___/                Setting the ELPA real_kernel failed             *
* |                                                                      *
*  O/|                                                                      *
* /| |                                                                      *
* / \                                                    fm/cp_fm_elpa.F:474 *
*******************************************************************************

===== Routine Calling Stack =====

         10 cp_fm_diag_elpa_base
         9 cp_fm_diag_elpa
         8 eigensolver
         7 qs_scf_new_mos
         6 scf_env_do_scf_inner_loop
         5 scf_env_do_scf
         4 qs_energies
         3 qs_forces
         2 qs_mol_dyn_low
         1 CP2K

以上部分在文件最后连续出现好几次，应该是并行出现了问题，但是部分节点就没有问题。

请各位大佬帮忙，感谢

作者
Author: jiangning198511 时间: 2021-7-1 15:15
你编译完后有没有测试一下例子文件看是否正常，另外如果elpa不是必须的话可以在重新编译的时候不要加入，看看是否能解决

作者
Author: xiaoboy 时间: 2021-7-2 08:41
例子文件是正常的，而且在部分节点上可以进行正常的计算的。只是把作业提交的其他节点的就会出现上面的错误/
我怀疑可能是环境变量哪里出问题了，但是改了半天也不对。
如果想用mpirun并行的话是不是必须要用到elpa？（我也不清楚）。
之前装过一个ssmp多线程的版本，但是要比popt的版本慢近三倍。

作者
Author: abin 时间: 2021-7-2 12:18

xiaoboy 发表于 2021-7-2 08:41
例子文件是正常的，而且在部分节点上可以进行正常的计算的。只是把作业提交的其他节点的就会出现上面的错误 ...

集群设定问题。

如有集群运维管理员，找他。

或者自己解决。

或者，我估计也能解决，有偿。联系方式看签名。
祝好。

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