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标题: psi4无法运行了求原因 [打印本页]

作者
Author: Kikyou 时间: 2021-7-6 09:34
标题: psi4无法运行了求原因
本帖最后由 Kikyou 于 2021-7-6 09:34 编辑

几个月前按照Sob老师的帖子安装好了PSI4，一切正常，也能正常计算。
前两天想再用的时候，发现无法调用了。集群上的报错指令如下：
Traceback (most recent call last):
  File "/home/chem/theochem/kikyou/Software/PSI4/lib//python3.6/site-packages/psi4/__init__.py", line 55, in <module>
from . import core
ImportError: cannot import name 'core'

During handling of the above exception, another exception occurred:

Traceback (most recent call last):
  File "/home/chem/theochem/kikyou/Software/PSI4/bin/psi4", line 177, in <module>
import psi4
  File "/home/chem/theochem/kikyou/Software/PSI4/lib//python3.6/site-packages/psi4/__init__.py", line 60, in <module>
raise ImportError("{0}".format(err))
ImportError: cannot import name 'core'

我比较疑问的地方是这个python3.6路径前面为啥有两个“//”？按Sob老师的帖子里也没有提到配置python的环境啥的。
当时在QQ群里得到的回复是这样的：”双//是因为你python或psi4环境变量里最后加了一个/，系统会自动补/，这样最终就有2个/。你检查一下自己的~/.bashrc，及其他任何可能写环境变量的地方就知道了。你的问题是python或psi4环境变量没写/没写对/提交任务的脚本里没有合适的环境变量/提交任务的脚本里写了没用的、其他版本的python环境变量。“

但是我不是很理解，因为我没有添加python的环境变量。如果问题是这个的话那该在哪改呢？我的~/.bashrc里就是按Sob老师帖子里来的只添加了两行：
export PATH=$PATH:/home/chem/theochem/kikyou/Software/PSI4/bin
export PSI_SCRATCH=/home/chem/theochem/kikyou/Software/PSI4/psi4scr

也不知道是不是有别人加了什么环境变量啥的，我对Linux和python了解的不多，谢谢各位老师！

作者
Author: zjxitcc 时间: 2021-7-6 10:01
本帖最后由 zjxitcc 于 2021-7-6 10:13 编辑

群里也是我回复的，注意我用的是“python或psi4环境变量”。而且我下一句说了双//的问题一般不影响使用，你没有展示出来。你可以运行
which python
which psi4
等命令检查一下路径情况。如果集群上分配到另一台节点做计算，你要注意其他节点的python又是啥版本。

如果你实在搞不清楚环境变量，直接把现在的PSI4文件夹删了，然后按此文重装一遍就好了《PSI4程序安装及运行》，整个过程就3 min的事，比群里到这里发帖过了这么久快多了

作者
Author: Kikyou 时间: 2021-7-6 10:32

zjxitcc 发表于 2021-7-6 10:01
群里也是我回复的，注意我用的是“python或psi4环境变量”。而且我下一句说了双//的问题一般不影响使用， ...

嗯嗯，谢谢老师！我也决定要重装了，确实我也搞不懂这些环境变量

作者
Author: abin 时间: 2021-7-6 11:41

Kikyou 发表于 2021-7-6 10:32
嗯嗯，谢谢老师！我也决定要重装了，确实我也搞不懂这些环境变量

create a new user, then install PSI4 for that user.

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