计算化学公社

标题: CP2K7.1编译问题: 计算节点找不到libblas.so.3 [打印本页]

作者
Author: Zhangpc 时间: 2021-7-6 10:59
标题: CP2K7.1编译问题: 计算节点找不到libblas.so.3
本帖最后由 Zhangpc 于 2021-7-6 17:46 编辑

借助toolchain：
./install_cp2k_toolchain.sh \
--with-gcc=install \
--with-mpich=install \
--with-openblas=install \ (此处换成mkl也是遇到以下问题)
--with-sirius=no \
--with-plumed=install

CP2K7.1编译顺利，不过编译输出的末尾出现：
/usr/bin/ld: warning: libgfortran.so.3, needed by //usr/lib64/libblas.so.3, may conflict with libgfortran.so.5

设置环境变量：
source /path/cp2k-7.1_mpich_openblas/tools/toolchain/install/setup
export PATH=$PATH:/path/cp2k-7.1_mpich_openblas/exe/local

在管理节点可以正常跑博文里（http://sobereva.com/587）的简单任务，但是计算节点报错：
cp2k.popt: error while loading shared libraries: libblas.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory

ldd exe/local/cp2k.popt显示：
libblas.so.3 => /lib64/libblas.so.3 (0x00007f7025f24000)

在/usr/lib64/下ll | grep libblas显示：
lrwxrwxrwx 1 root root       16 Jun 17 01:37 libblas.so -> libblas.so.3.4.2
lrwxrwxrwx 1 root root       16 Jun 17 01:37 libblas.so.3 -> libblas.so.3.4.2
lrwxrwxrwx 1 root root       16 Jun 17 01:37 libblas.so.3.4 -> libblas.so.3.4.2
-rwxr-xr-x 1 root root    364800 Aug  3  2017 libblas.so.3.4.2

请教如何解决，谢谢！

作者
Author: abin 时间: 2021-7-6 12:44
开ssh
我去弄。

如有需要，通过签名连接联系我。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-7-7 08:51
计算节点上yum（CentOS）或apt-get（Ubuntu）把blas库装上就完了，一行命令的事

另外，不建议用那么老的CP2K

作者
Author: maoxinxina 时间: 2025-4-23 09:30
请教一下最后是怎么设置的，我也遇到了类似的问题：cp2k.popt: error while loading shared libraries: libgfortran.so.5: cannot open shared object file: No such file or directory

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)