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标题: 请各位大佬帮忙给点意见,尝试了卢老师博文中的所有方法,均SCF不收敛 [打印本页]

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nianbin    时间: 2021-7-6 15:49
标题: 请各位大佬帮忙给点意见,尝试了卢老师博文中的所有方法,均SCF不收敛
本帖最后由 nianbin 于 2021-7-6 15:51 编辑

我想做一下两个Fe3+离子与有机小分子的配合物的结构优化进而进一步算出binding energy,但是这个结构始终无法SCF收敛,用了卢老师博文http://sobereva.com/61?tdsourcetag=s_pctim_aiomsg,中的解决SCF收敛的办法,仍然无法奏效,请各位老师给点意见,谢谢

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wzkchem5    时间: 2021-7-6 16:04
结构不合理。建议找本配位化学的教材看一下,Fe3+是怎么配位的。
不是你随便把两个Fe3+和有机分子放在一起,然后优化就可以的。初始结构必须大体上合理,不能指望如此异想天开的结构,高斯还能给你优化出来。竟然还让两个Fe3+彼此成键,真不知道怎么想的。就算你一点配位化学都没学过,哪怕学过初中物理都知道,电荷同性相斥,结果你硬是把两个高达+3价的离子放得这么近,都成键了,你觉得能合理吗?
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wzkchem5    时间: 2021-7-6 16:07
一般而言,现实中不存在的结构,SCF出现不收敛问题的概率会大得多。这是因为,一般的DFT方法本来就是为那些合理的结构而设计的,对于不合理的结构,DFT的基本假设(体系可以用单参考态波函数定性描述)根本不成立,所以第一容易不收敛,第二即使收敛了结果也没有用。
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fatpig    时间: 2021-7-6 19:35
能设成singlet基本表示...楼主就是算着玩的,所以不收敛也很正常吧...
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nianbin    时间: 2021-7-6 19:44
fatpig 发表于 2021-7-6 19:35
能设成singlet基本表示...楼主就是算着玩的,所以不收敛也很正常吧...

1 3 5 7 都试了
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nianbin    时间: 2021-7-6 19:45
wzkchem5 发表于 2021-7-6 16:07
一般而言,现实中不存在的结构,SCF出现不收敛问题的概率会大得多。这是因为,一般的DFT方法本来就是为那些 ...

多谢老师,这个结构是使用molclus联合xtb搜索出来的,应该是有问题,我重新弄一下
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k64_cc    时间: 2021-7-6 20:18
xtb不少时候都不对,还是要把化学直觉放第一位呀。
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wzkchem5    时间: 2021-7-6 20:24
nianbin 发表于 2021-7-6 12:45
多谢老师,这个结构是使用molclus联合xtb搜索出来的,应该是有问题,我重新弄一下

xtb你设置了电荷了吗?虽然xtb不是特别靠谱,但是不至于让两个带+3价的Fe跑到一起。估计你是没有设置体系总电荷,导致xtb按总电荷为0算的
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nianbin    时间: 2021-7-6 20:52
wzkchem5 发表于 2021-7-6 20:24
xtb你设置了电荷了吗?虽然xtb不是特别靠谱,但是不至于让两个带+3价的Fe跑到一起。估计你是没有设置体系 ...

老师好,xtb设置了电荷+6
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nianbin    时间: 2021-7-6 20:52
k64_cc 发表于 2021-7-6 20:18
xtb不少时候都不对,还是要把化学直觉放第一位呀。

是的,感谢
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wzkchem5    时间: 2021-7-6 22:58
nianbin 发表于 2021-7-6 12:44
1 3 5 7 都试了

这个分子是弱场配体,两个Fe都是高自旋d5,所以应该是11重态。即使更低的自旋态更稳定,也应该从11重态做broken symmetry。
所以还是那句话,要靠化学直觉,不能不动脑子盲试。别人试到7重态就不试了,那是因为别人是单金属配合物,或者强场配合物,或者不成对d电子没那么多。不代表你也是试到7重态就可以停了。
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wzkchem5    时间: 2021-7-6 23:01
nianbin 发表于 2021-7-6 13:52
老师好,xtb设置了电荷+6

我用GFN2-xTB给你的初始结构做结构优化,电荷+6,自旋多重度11,发现有一个Fe会跑开。你现在这个结构如果是用xtb找的,肯定说明还是算得有问题,比如电荷没传对,或者自旋多重度没设对。
建议仔细阅读xtb的输出文件(不是molclus的输出文件),确保你所有都设对了,也都正确地传给xtb了。
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nianbin    时间: 2021-7-7 00:14
wzkchem5 发表于 2021-7-6 22:58
这个分子是弱场配体,两个Fe都是高自旋d5,所以应该是11重态。即使更低的自旋态更稳定,也应该从11重态做 ...

非常感谢wzkchem5老师




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