计算化学公社

标题: Au-TiO2 建模及计算求助 [打印本页]

作者
Author: Stargazing 时间: 2021-7-7 13:46
标题: Au-TiO2 建模及计算求助
最近在对Metal-TiO2 系统进行建模，网上相关的文章很多，也阅读了不少，目前想先从Au-TiO2入手。在这篇文章：J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 12717-12723 中发现这样一段话，提到说 All of the Au atoms were allowed to relax in the Z direction。对这里的建模方法，有两点想请教大家：
1. 这个三层的Au是怎么建出来的？是拿Au111面切的吗，尝试了一下没能在MS当中切出来这样的形状？
2. 为什么保证xy不动，只在Z direction上relax呢？

感谢大家讨论！

作者
Author: Stargazing 时间: 2021-7-7 13:57
再补一张图

作者
Author: lyfchem 时间: 2021-7-7 13:58
目测感觉是纳米棒是切出来的你显示可以选择original那个

作者
Author: Stargazing 时间: 2021-7-7 14:43

lyfchem 发表于 2021-7-7 13:58
目测感觉是纳米棒是切出来的你显示可以选择original那个

是的是的，是纳米棒！请问能展开说说怎么切的吗？非常感谢

作者
Author: jiangning198511 时间: 2021-7-7 16:30
第二个问题用VASP限制优化, 在POSCAR里面所以的Au F F T

作者
Author: Stargazing 时间: 2021-7-7 16:42

jiangning198511 发表于 2021-7-7 16:30
第二个问题用VASP限制优化, 在POSCAR里面所以的Au F F T

是的，谢谢你，我知道如何在VASP中去做限制性优化。这里1我想问的是为什么要对Au进行限制呢？x和y为什么要固定不动？为什么只有z方向relax?

作者
Author: jiangning198511 时间: 2021-7-8 09:18

Stargazing 发表于 2021-7-7 16:42
是的，谢谢你，我知道如何在VASP中去做限制性优化。这里1我想问的是为什么要对Au进行限制呢？x和y为什么 ...

我猜测这个模型如果全放开就会跑变形，无法实现作者的想法吧，并且计算量估计会变大

作者
Author: Stargazing 时间: 2021-7-8 09:37

jiangning198511 发表于 2021-7-8 09:18
我猜测这个模型如果全放开就会跑变形，无法实现作者的想法吧，并且计算量估计会变大

确实，可能还是和他所谓的nanorod形状有关，再次感谢。

作者
Author: Stargazing 时间: 2021-7-8 09:37

lyfchem 发表于 2021-7-7 13:58
目测感觉是纳米棒是切出来的你显示可以选择original那个

若有时间的话，能否麻烦您简单说说这个形状是怎么切出来的呢，感谢！

作者
Author: 朱陈 时间: 2021-7-9 15:58
直接切是切不出来的，需要手动搭一下。

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Author: Stargazing 时间: 2021-7-9 20:48

朱陈发表于 2021-7-9 15:58
直接切是切不出来的，需要手动搭一下。

那么为什么是这样搭呢？（比如为什么是三层、为什么是2-3-3这样的分布）？感谢赐教！

作者
Author: 朱陈 时间: 2021-7-14 10:06

Stargazing 发表于 2021-7-9 20:48
那么为什么是这样搭呢？（比如为什么是三层、为什么是2-3-3这样的分布）？感谢赐教！

至于搭几层，就看你自己的研究了，我也见过搭两层的。这个文献的作者这么搭首先是为了和载体的晶胞尺寸匹配的更好，还有就是上表面和右表面暴露的是111面。

作者
Author: Stargazing 时间: 2021-7-14 10:09

朱陈发表于 2021-7-14 10:06
至于搭几层，就看你自己的研究了，我也见过搭两层的。这个文献的作者这么搭首先是为了和载体的晶胞尺寸匹 ...

感谢！

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