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标题: 求助rmsf得到的图片很乱，而且残基数目也不对 [打印本页]

作者
Author: 小饼子 时间: 2021-7-8 14:50
标题: 求助rmsf得到的图片很乱，而且残基数目也不对
老师们好：
现在通过动力学模拟可以得到初步的结果，但后续分析的话，想分析抗体的rmsf和bfactor，是如下口令，gmx rmsf -s md.tpr -f md_center.xtc -o rmsf1.xvg -n index.ndx -res，得到的图片很乱，而且残基数目也不对，是因为VL,VH叠加在一起了么，如何让他们分开呢，另外如果是抗原抗体复合物，也想计算rmsf该怎么设置呢，谢谢老师

作者
Author: 小饼子 时间: 2021-7-8 15:05
后续选择的是protein

作者
Author: sobereva 时间: 2021-7-9 08:18

小饼子发表于 2021-7-8 15:05
后续选择的是protein

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，这点在置顶的新社员必读贴里明确说了

作者
Author: sobereva 时间: 2021-7-9 08:26
发帖时不要用VL、VH这样别人根本不知道什么意思的词
手动打开xvg文件，看里面是怎么回事

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