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标题: 在用genmer生成初始构型时，genmer找不到.xyz文件 [打印本页]

作者
Author: 小七丫 时间: 2021-7-12 21:23
标题: 在用genmer生成初始构型时，genmer找不到.xyz文件
l老师，我想请教一下我的路径应该怎么写才是正确的，现在显示找不到.xyz文件，现在写的是当前路径，显示找不到文件；用示例中的路径写法examples/Sorbitol.xyz，genmer会闪退打不开找不到文件的情况：
(, 下载次数 Times of downloads: 28)
(, 下载次数 Times of downloads: 16)

闪退的情况：
(, 下载次数 Times of downloads: 22)

作者
Author: sobereva 时间: 2021-7-12 23:09
路径没必要加双引号
Windows下目录分隔符用\
仔细一个字符一个字符检查路径。这都是计算机使用常识问题，和genmer本身毫无直接关系。

作者
Author: 小七丫 时间: 2021-7-13 10:51
嗯嗯，是我把原子个数数错了才闪退的

作者
Author: 小七丫 时间: 2021-7-13 11:07
还有我把genmer生成的trail.xyz文件拖入VMD查看，看不到Fe是什么原因呢，只能看到山梨糖醇 (, 下载次数 Times of downloads: 36) ，我想查找山梨糖醇和铁的螯合构象，生成50个可以吗，之后再用高斯进行结构优化？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-7-13 16:05

小七丫发表于 2021-7-13 11:07
还有我把genmer生成的trail.xyz文件拖入VMD查看，看不到Fe是什么原因呢，只能看到山梨糖醇，我想查找山梨糖 ...

明明能看见。眼睛或屏幕不好就开放大镜
(, 下载次数 Times of downloads: 29)

line方式显示当然不便于观看单个原子。用CPK

50个可以

作者
Author: 小七丫 时间: 2021-7-15 09:06
是我不够仔细了，谢谢老师

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