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标题: MS建模如何在含有溶质的盒子中添加溶剂水 [打印本页]

作者
Author: 王一伊 时间: 2021-7-13 11:08
标题: MS建模如何在含有溶质的盒子中添加溶剂水
如题，希望利用MS在已经建好的含有溶质分子的盒子中随机加入一定量的水分子。整体的盒子大小及密度已经计算好，只是希望在建盒子的过程中保证溶质在中间位置且水分子随机分布，恳请各位老师解答~

作者
Author: naoki 时间: 2021-11-13 21:13
M$好像没办法实现这种操作 GROMACS可以

作者
Author: 王一伊 时间: 2021-11-13 21:57

naoki 发表于 2021-11-13 21:13
M$好像没办法实现这种操作 GROMACS可以

好的，谢谢您~

作者
Author: zaqxs234 时间: 2021-12-24 19:59
MS里AC模块选择packing就可以在原体系上加入你需要的溶剂分子（需设定溶剂密度）

作者
Author: 王一伊 时间: 2021-12-24 20:52

zaqxs234 发表于 2021-12-24 19:59
MS里AC模块选择packing就可以在原体系上加入你需要的溶剂分子（需设定溶剂密度）

感谢~想问下您MS是哪个版本呀，我用的这个没有找到这个板块

作者
Author: zaqxs234 时间: 2021-12-25 10:57
一般都有吧（我用的是MS.2019），AC里面Task-packing，默认是Constrution,改一下就好了

作者
Author: xiaoj 时间: 2022-3-29 22:40

zaqxs234 发表于 2021-12-24 19:59
MS里AC模块选择packing就可以在原体系上加入你需要的溶剂分子（需设定溶剂密度）

您好，请问packing模块下添加分子需要制定摩尔比，这个摩尔比是谁比谁？

作者
Author: chen0201 时间: 2023-1-2 17:17
请问楼主解决了吗，我为什么添加不了呢

作者
Author: lll. 时间: 2023-3-18 15:25
楼主可以用MS在构建好的盒子内添加一定量的水分子吗，我需要在无定形晶胞内添加水

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