计算化学公社

标题: VMD程序不执行脚本?怎么办 [打印本页]

作者
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iamlongwei    时间: 2021-7-14 11:35
标题: VMD程序不执行脚本?怎么办
各位高人:

我看了很多帖子,关于 Multiwfn导出的cub文件,再用VMD程序打开可以套用脚本形成艺术级轨道或等值面图。
我反复尝试了多遍,Gaussian计算出CHK文件,转化为fch文件,然后调用Multiwfn导出的cub文件,这些都成功了。
VMD程序也安装了,可以运行,按照帖子里的方法,把找到的那个showcub文件复制过去,再修改VMD.RC文件
我感觉就是这里出了问题,插入指令source showcub.vmd指令没有发挥作用。

我发现2个问题,第1, 为什么VMD的程序命令中录入  cub ***  0.01后提示cub命令不识别,而直接把cub文件拖入display窗口中又能加载?这是为什么?

第2,在修改VMD.RC文件是没有搞清楚,是用记事本打开吗?进入后如下代码,如何加?是空一行吗?

# User's default values for newly loaded molecules/reps, etc
#  mol default color {colorID 5}
#  mol default style {NewCartoon 0.300000 6.000000 4.100000 0}
#  mol default selection {name CA}
#  mol default material {Transparent}
source showcub.vmd

这样写后运行VMD根本不起作用,请问各位高手,如果要调用脚本,代码后面应该怎么加啊?
还有,我发现我的笔记本电脑居然是64位的,是不是我的VMD程序版本错了,我用的是1.9.3版本。
盼求助,谢谢。




作者
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winnerwill    时间: 2021-7-14 14:28
把source showcub.vmd
改成绝对路径,比如:
source {D:\Programs\VMD\showcub.vmd}
具体路径看文件实际所在位置。
设好重新打开程序。
作者
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sobereva    时间: 2021-7-14 15:21
看文字如果还看不明白,仔细照着文中的视频操作,还重复不出来那就无语了
用VMD绘制艺术级轨道等值面图的方法(含演示视频)
http://sobereva.com/449http://bbs.keinsci.com/thread-11550-1-1.html
作者
Author:
iamlongwei    时间: 2023-2-8 09:59
电脑win10下面对文件写入受限制,解除了权限后可以看到指令正常,可以出图,cub命令可行。
但还有点问题是full.bmp文件好像不出来
作者
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Tracy民工    时间: 2024-11-18 11:34
winnerwill 发表于 2021-7-14 14:28
把source showcub.vmd
改成绝对路径,比如:
source {D:\Programs\VMD\showcub.vmd}

试了一下,是这样的,要写绝对路径




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