计算化学公社
标题:
求助:GROMACS在grompp的时候软件出错问题
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作者Author:
1971806673
时间:
2021-7-16 15:57
标题:
求助:GROMACS在grompp的时候软件出错问题
老师,您好,我建立了加速组和冻结组之后,将两个组放在一个索引文件里面,在mdp文件添加了控制参数,如下所示:
acc-grps = acc
accelerate = 0.1 0.0 0.0
freezegrps = freeze
freezedim = Y Y Y
然后我运行命令:gmx grompp -f mdaf.mdp -c npt.gro -n accfreeze.ndx -p topol.top -o mdaf.tpr 准备生成tpr文件,结果软件无法生成tpr文件并报了如下图片的错误,我用的是windows下的gmx 2020.3,
不知道什么问题,麻烦老师解答一下,谢谢老师。
作者Author:
sobereva
时间:
2021-7-17 02:30
没法简单判断,可能输入文件里的设置有硬伤,把输入文件里的条件尽可能简化反复尝试弄清楚原因。也有可能是windows版本身有问题,尝试linux版。
作者Author:
1971806673
时间:
2021-7-17 09:04
好的,谢谢老师。
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