计算化学公社

标题: 求助:运行gmx mdrun出错 [打印本页]

作者
Author:
1971806673    时间: 2021-7-17 11:23
标题: 求助:运行gmx mdrun出错
老师,您好,我在Linux系统下运行命令 :gmx mdrun -v -deffnm mdaf,显示这样的错误:Step 0  Warning: pressure scaling more than 1%, mu: -3.05688e+25 -3.05688e+25 -3.05688e+25step 0Warning: Triclinic box is too skewed. 详细内容我截屏上传了,希望老师可以看一下,谢谢老师。



作者
Author:
sobereva    时间: 2021-7-17 15:12
没细节没法说,至少提供初始的gro文件和mdp
作者
Author:
1971806673    时间: 2021-7-17 20:14
老师,您好,我将npt.gro文件截图(文件太大无法上传),索引文件(加速组和冻结组)、mdaf.mdp文件上传给您了,麻烦老师您看一下,谢谢您老师。

作者
Author:
jiajh    时间: 2021-7-25 17:35
这个忙有点儿大~




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3