计算化学公社

标题: def-TZVP基组对于Mg严重错误 [打印本页]

作者
Author:
sobereva    时间: 2015-12-24 17:53
标题: def-TZVP基组对于Mg严重错误
发现一个TZVP(即def-TZVP)对于Mg的重大问题。
Mg2,实验值是3.891埃。B3LYP/TZVP优化出来是9.44346412,完全离谱,势能面扫描居然没有极小点。而小得多的B3LYP/6-31G优化出来是4.15119913,基本合理,有个很浅的势阱。
仔细对照基组,发现TZVP最外层P函数弥散程度严重不足,指数最小的是0.189,最外层S函数指数是0.037。而6-31G指数最小的S和P都是0.042。可见,TZVP的S弥散程度够了,但是P的弥散程度太低。

于是尝试将6-31G最外层P加到TZVP上,即
Mg 0
TZVP
P   1 1.00       0.000000000000
      0.4210610000D-01  0.1000000000D+01
****
结果为4.25734179埃,基本合理了!可见就是TZVP的P的指数不合理。

这还是第一次被TZVP坑,以后可不敢轻易用这个搞碱土金属了。def2TZVP倒是没这个问题,结果为3.95371264。




又做了补充测试:
Ca2实验值4.2773,B3LYP/TZVP结果:4.7818,def2TZVP结果:4.3636,6-31G*结果:4.6637,6-311G*结果:4.4193
K2实验值3.9051 ,B3LYP/TZVP结果:3.9773,6-31G*结果:3.9721,6-311G*结果:3.9693
Na2实验值3.0788 ,B3LYP/TZVP结果:3.0718,6-31G*结果:3.0378,6-311G*结果:3.0516
Li2实验值2.6729 ,B3LYP/TZVP结果:2.708,6-31G*结果:2.7228,6-311G*结果:2.7047

Be2没有束缚态所以没法测试,但对于Ca,明显看出TZVP也很不理想,居然还不如6-31G*。而def2-TZVP则比TZVP大大改进了结果,消除了bug。
所以,TZVP不要用于碱土金属!用于碱金属倒没问题。

作者
Author:
helpme    时间: 2015-12-24 18:25
竟然。看来确实泛函和基组都要测试了才能用。
作者
Author:
我本是个娃娃    时间: 2015-12-24 18:37
老师,这个有没有影响别的性质的使用?
作者
Author:
sobereva    时间: 2015-12-24 19:14
我本是个娃娃 发表于 2015-12-24 18:37
老师,这个有没有影响别的性质的使用?

反正对Mg一定不要用,对其它碱土金属都慎用。对于有机体系很安全
作者
Author:
我本是个娃娃    时间: 2015-12-24 19:24
sobereva 发表于 2015-12-24 19:14
反正对Mg一定不要用,对其它碱土金属都慎用。对于有机体系很安全

基组检测应该是很严格的,怎么会这么不小心,不过我一般优化几何都是用波普尔基组,加上极化和弥散,应该没什么问题吧
作者
Author:
sobereva    时间: 2015-12-25 07:13
我本是个娃娃 发表于 2015-12-24 19:24
基组检测应该是很严格的,怎么会这么不小心,不过我一般优化几何都是用波普尔基组,加上极化和弥散,应该 ...

没问题
作者
Author:
我本是个娃娃    时间: 2015-12-25 08:54
sobereva 发表于 2015-12-25 07:13
没问题

看来几何优化的基组没必要用那么高,水平也不比太精细,够用就行
作者
Author:
ikea1984    时间: 2015-12-26 20:15
基组其实很多时候都有些问题,不过不同体系不一定会表现而已。我薄厚老板曾近发现Cu的好像是6-31G*的基组不对,Y还写了篇文章
还有就是周期性计算的赝势,那才是问题百出,包括VASP的赝势库
所以很多时候为了求个心安,同一个东西都得用几个基组或者几个程序算算才敢相信
作者
Author:
虎王    时间: 2022-6-10 22:04
sobereva 发表于 2015-12-24 19:14
反正对Mg一定不要用,对其它碱土金属都慎用。对于有机体系很安全

对于含金银铜的配合物呢?
作者
Author:
虎王    时间: 2022-6-10 22:05
ikea1984 发表于 2015-12-26 20:15
基组其实很多时候都有些问题,不过不同体系不一定会表现而已。我薄厚老板曾近发现Cu的好像是6-31G*的基组不 ...

那老板待你是薄还是厚呢?

作者
Author:
sobereva    时间: 2022-6-11 15:30
虎王 发表于 2022-6-10 22:04
对于含金银铜的配合物呢?

没什么必要用def-TZVP
作者
Author:
虎王    时间: 2022-6-16 00:00
sobereva 发表于 2022-6-11 15:30
没什么必要用def-TZVP

那推荐怎样的全电子基组呢?希望优化金银铜配合物并计算性质。def2-TZVP的话优化太慢。
作者
Author:
aaq2800    时间: 2022-6-16 08:31
Sob老师,这些实验数据的参考文献能否提供一下,谢谢!!!
作者
Author:
sobereva    时间: 2022-6-16 10:14
虎王 发表于 2022-6-16 00:00
那推荐怎样的全电子基组呢?希望优化金银铜配合物并计算性质。def2-TZVP的话优化太慢。

看具体什么目的
本来def、def2系列对于银、金也不是全电子基组。
而且全电子基组算银、金得用相对论哈密顿,在Gaussian里还没解析梯度,严重不适合

作者
Author:
虎王    时间: 2022-6-16 15:55
sobereva 发表于 2022-6-16 10:14
看具体什么目的
本来def、def2系列对于银、金也不是全电子基组。
而且全电子基组算银、金得用相对论哈 ...

那只管Cu也行。对于含CuCNH和卤素的配合物,如果要进行几何优化、电子跃迁计算、IGMH计算等,用什么基组比较合适。之前用(Lanl2dz+6-31G**),现在想用大点的基组。另外,对这类体系做ICSS计算的话,一般(Lanl2dz+6-31G*)是合适的吧?
作者
Author:
虎王    时间: 2022-6-16 15:57
sobereva 发表于 2022-6-16 10:14
看具体什么目的
本来def、def2系列对于银、金也不是全电子基组。
而且全电子基组算银、金得用相对论哈 ...

感觉有时想对Cu用大一点的基组,但是要和金银的体系比较时,也大不起来。
作者
Author:
sobereva    时间: 2022-6-17 15:47
虎王 发表于 2022-6-16 15:55
那只管Cu也行。对于含CuCNH和卤素的配合物,如果要进行几何优化、电子跃迁计算、IGMH计算等,用什么基组 ...

SDD
此文说了
谈谈赝势基组的选用
http://sobereva.com/373http://bbs.keinsci.com/thread-5625-1-1.html
作者
Author:
sigma-jlu    时间: 2023-8-2 13:31
这周发现,def2-TZVP基组对于铁元素,也会带来scf不收敛【同样初猜结构下,DZVP-MOLOPT-SR-GTH能稳定收敛】。
作者
Author:
sobereva    时间: 2023-8-2 23:20
sigma-jlu 发表于 2023-8-2 13:31
这周发现,def2-TZVP基组对于铁元素,也会带来scf不收敛【同样初猜结构下,DZVP-MOLOPT-SR-GTH能稳定收敛】 ...

对于算孤立体系,def2-TZVP对于Fe并不会比其它基组收敛更难。对于周期性体系,由于原子密集堆积,更容易出现线性相关问题,完全广义收缩的MOLOPT系列基组的这个问题相对更弱。只能说MOLOPT系列比一般的基组更适合周期性体系计算,而不是def2-TZVP自身有问题




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3