计算化学公社

标题: 蛋白质在混合溶剂水溶液下分子动力学模型的构建问题 [打印本页]

作者
Author: xryao 时间: 2021-7-25 09:14
标题: 蛋白质在混合溶剂水溶液下分子动力学模型的构建问题
GROMACS小白想请教一下大家，我想研究蛋白质（如二肽）在混合溶剂（如氯化胆碱：甲酸）水溶液下的分子动力学问题，但是模型的构建困扰了我好久，应该使用packmol得到包含氯化胆碱：甲酸+水的盒子.pdb文件再用GROMACS插入蛋白质分子，还是怎么搞哇，大家有没有做过类似的算例，望不吝指教，谢谢大家。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-7-26 00:28
packmol构建就完了

作者
Author: xryao 时间: 2021-7-26 10:19

sobereva 发表于 2021-7-26 00:28
packmol构建就完了

好的谢谢老师

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)