计算化学公社

标题: 如何获取力常数矩阵 [打印本页]

作者
Author: baobao123 时间: 2021-7-25 15:20
标题: 如何获取力常数矩阵
用mesmer计算反应速率需要用到hessian矩阵，用了社长的工具不太好使，MESMER算出来的频率和GUASSIAN算出来的完全不同，有很多虚频，推测应该是hessian矩阵错误；留意了一下软件手册，有说到“WARNING: When calculating frequencies from a Hessian, including the case when internal rotor degrees of freedom are projected out, it is critical that the Hessian and species coordinates presented to MESMER are expressed relative to the same Cartesian coordinate system.”，推测可能不是在相同笛卡尔坐标下的原因，请问这种情况怎么办获取正确的hessian呢，.out文件没有hessian矩阵，即使加了关键词#P也没用。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-7-26 00:29
不要说什么莫名其妙的“用了社长的工具不太好使”
用的什么工具？怎么用的？怎么不好使？
提问时候要有最基本的逻辑。你这种描述只会严重误导他人

Gaussian做完freq里的fch文件里就有Hessian矩阵，怎么提取和利用在此文里都已经充分体现了
基于fch中的Hessian矩阵计算振动频率的简单程序Hess2freq
http://sobereva.com/328（http://bbs.keinsci.com/thread-3368-1-1.html）

弄不对是你自己的问题
至于MESMER程序自身特征、怎么把已有的Hessian结合到MESMER里用完全是另外一码事

拼错程序名是非常丢人的事情
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298（http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html）

还有个超级常见的情况就是拼不对Gaussian（高斯）。拼法真是五花八门，是所有计算化学程序里名字拼错种类最多的，据笔者答疑时的不完全统计，有：guass、Guassian（瓜斯）、Gaussion（高身）、Gausson（高孙）、Gassian（嘎斯）、Gauss、Guaasian（瓜三）、Gassian（嘎斯）、Gussain（孤塞恩）、Gussion（孤身）、GAUSSIOIAN、guassion（瓜身）...真是不胜枚举。也往往见到把GaussView写成Gaussian View的情况。这都是菜鸟提问、菜鸟文章、低水平毕业论文里极为常见错误。拼对个程序名怎么就那么难？？？搞科研最基本的素养就是严谨，连个自己常用的程序名都拼不对还搞什么研究！？笔者不指望那些混文凭的学生能搞出什么科研成果，但起码也应该在科研的历练过程中把基本的科学素养和严谨的态度提升上去。

作者
Author: 独行浪人 时间: 2024-7-6 21:23
你好，请问你这个问题后来解决了吗？可以加个好友吗，交流下MESMER的使用经验，我的联系方式，Q，1762163509

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