计算化学公社

标题: 求助关于负离子，正离子在高斯计算中的问题 [打印本页]

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Author: jw227 时间: 2021-7-26 10:09
标题: 求助关于负离子，正离子在高斯计算中的问题
请问负离子和正离子在极性有机溶剂里都用离子表示吗，计算了几次金属离子脱除乙酰基团，金属离子脱除F，感觉直接用金属离子，作用很怪，到处成键，而且造成苯环变形，和苯环上氢都会有成键，这种情况如何处理？

作者
Author: zjxitcc 时间: 2021-7-26 10:13
关于成键，看Sob老师这篇博文《谈谈原子间是否成键的判断问题》http://sobereva.com/414
关于“苯环上氢都会有成键”，如果金属与苯环上的氢距离过近，有可能有某种元素忘记写它的基组（和/或赝势）了；或者你写了但格式不对，高斯没读进去。可以看这篇《详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入》http://sobereva.com/60

作者
Author: jw227 时间: 2021-7-26 10:49
我想问一般用在极性溶剂中，都是用离子计算吗，怎么判断化合物存在的形式，可以直接用阳离子或阴离子找过渡态吗，怎么老觉得很怪

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-7-26 14:45

jw227 发表于 2021-7-26 03:49
我想问一般用在极性溶剂中，都是用离子计算吗，怎么判断化合物存在的形式，可以直接用阳离子或阴离子找过渡 ...

如果溶剂和离子之间有配位作用或者强氢键，参与配位或者形成氢键的溶剂分子必须显式描述，光用隐式溶剂模型是不行的。如果用了显式溶剂仍然出现你说的问题，再按照zjxitcc说的检查

作者
Author: jw227 时间: 2021-7-26 19:15
本帖最后由 jw227 于 2021-7-26 19:30 编辑

请问比如Cs2CO3在二氧六环溶剂里的有机反应,拔去反应物卤素，终产物是CsCl2，Cs2CO3类似于Na2CO3, 反应中是按na+ CO32-离子，还是显式溶剂化的正负离子呢?

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-7-30 20:30

jw227 发表于 2021-7-26 12:15
请问比如Cs2CO3在二氧六环溶剂里的有机反应,拔去反应物卤素，终产物是CsCl2，Cs2CO3类似于Na2CO3, 反应中是 ...

显式溶剂化的离子对。高价离子在这种极性不是特别强的溶剂里，一般不是游离离子，而是离子对。所以应该把两个Cs+、一个CO32-和足够多的二氧六环分子放在一起做构型搜索，取能量最低的。

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