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标题: 求助Dmol3计算差分电荷密度 [打印本页]

作者
Author: xiapin 时间: 2021-7-28 22:04
标题: 求助Dmol3计算差分电荷密度
在利用Dmol3计算差分电荷得到三个grd文件后作图遇到困难：现得到差值文件，记作C： C.grd=AB.grd - A.grd - B.grd，将C.grd导入MS里面分析Total电子密度，
得到图1（工作目前还没做完，截了一部分，但整体上都是像这样黄色分布），疑问1：每个原子都能是电荷增加吗？
还利用Multiwfnj进行上述做差，得到C.cub文件，用VESTA打开之后如图2，也都是黄色，疑问2：是不是操作方法的问题？
看到帖子http://bbs.keinsci.com/thread-10559-1-1.html，社长回复可以用VMD和Gview作图，文件C.cub导入VMD，
只有一个H原子；导入Gview,得到一个厚厚的片层，但也不是想要的那种。
请问有什么作图经验吗？现在这些作图软件还不太会使用，正在学习。
@卡开发发 (, 下载次数 Times of downloads: 28) (, 下载次数 Times of downloads: 39)

作者
Author: 卡开发发 时间: 2021-7-29 09:17
可能哪个部分处理的有问题，例如截断半径的值是否完全相等（注意是值，而不是精度）。

作者
Author: xiapin 时间: 2021-7-29 10:38
卡老师，方便私信发您帮忙给看一下吗？

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