计算化学公社

标题: 基于TrEsp计算的激子耦合能中出现的计算问题以及对说明书中公式的理解问题 [打印本页]

作者
Author:
量化新生    时间: 2021-7-31 10:31
标题: 基于TrEsp计算的激子耦合能中出现的计算问题以及对说明书中公式的理解问题
本帖最后由 量化新生 于 2021-7-31 15:04 编辑

3.8版本的Multiwfn说明书中4.A.9 Calculate TrEsp 3. Evaluating excitonic coupling energy based on TrEsp 补充了基于TrEsp计算的激子耦合能的计算方法以及公式,遇到以下困惑问题一、对于P893的公式,截图示于图一中,V00,00,V00,11和V01,10.是指Multiwfn第7模块的-2指令都可以计算吗。下角标的00,11,10以及01分别代表的什么?以及如何计算?
个人理解01是dimer1中的基态到激发态(S0-S1)的吸收过程,10是dimer中另一个单分子激发态到基态(S1-S0)的发射过程。那在计算激发态那步我们需要如何考虑到这两个过程。这三个库伦能在程序中又是如何操作得到?
(, 下载次数 Times of downloads: 7)
二、回到对激子耦合能的计算
具体说明书中步骤示于图2.有以下不理解的地方望指教。
step1. 优化二体结构。想要计算激子耦合能,我们是优化基态的二体结构吗?还是为得到10过程还需要优化激发态的二体结构?
step2. 如果上一步所示优化基态二体结构,这一步将二体拆分可理解。但如果还需计算激发态优化是取一个基态优化的几何结构,取一个激发态的几何结构,分别再做激发态计算吗?
(, 下载次数 Times of downloads: 13)
三、我的计算过程以及结果与文献中激子耦合能的对比我计算了Pengqian组的文章中的一个分子DPA激子耦合能,结果我的计算结果要比文献中的大两个量级。具体步骤以及二体结构和文章如下。希望帮助我指出我计算的问题,并请教一下:Multiwfn软件计算的激子耦合能与文献中的激子耦合能是同一个物理量吧?
列出DPA的dimer结构图如下
(, 下载次数 Times of downloads: 9)
1.opt freq b3lyp/6-31g(d)  优化二体基态计算
2.# td cam-b3lyp/6-31g(d) density=transition=1 nosymm out=wfn  激发态计算

3.利用.chg文件计算TrESP电荷,电荷如下图所示
(, 下载次数 Times of downloads: 8) (, 下载次数 Times of downloads: 6)

4.选择7模块,-2.分子片段。计算结果如下
(, 下载次数 Times of downloads: 14)
5.重复的文献以及文献结果
J. Phys. Chem. Lett. 2021, 12, 938-946  
https://dx.doi.org/10.1021/acs.jpclett.0c03453
(, 下载次数 Times of downloads: 8)
不知道怎么能把mol文件上传。只能贴在帖子上了。抱歉
DPA-dimer
  MatStudio         3D                             0
88 96  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000
   2.8457    4.4472    9.2755 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   3.0678    4.9972   10.0174 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   1.5364    4.4266    8.8087 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   0.8734    4.9552    9.2371 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   1.1935    3.6392    7.7241 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   0.2965    3.6194    7.4120 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   2.1690    2.8790    7.0967 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   1.9428    2.3460    6.3436 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   3.4772    2.8937    7.5647 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   4.1353    2.3666    7.1276 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   3.8424    3.6709    8.6691 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   5.2422    3.6981    9.1747 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   5.5206    4.1539   10.5062 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   4.7967    4.3605   11.0845 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   6.7930    4.2972   10.9627 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   6.9389    4.6038   11.8497 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   7.9141    3.9943   10.1288 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   7.6567    3.4715    8.8147 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   6.3049    3.3363    8.3790 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   6.1338    2.9856    7.5129 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   9.2303    4.1877   10.5474 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   9.3939    4.5362   11.4161 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   15.1262    0.7712   12.3794 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   14.9041    1.3212   11.6375 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   16.4354    0.7506   12.8461 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   17.0984    1.2792   12.4177 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   16.7783   -0.0368   13.9308 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   17.6753   -0.0566   14.2429 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   15.8028   -0.7970   14.5581 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   16.0291   -1.3300   15.3112 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   14.4947   -0.7823   14.0902 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   13.8365   -1.3094   14.5272 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   14.1295   -0.0051   12.9858 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   12.7296    0.0221   12.4801 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   12.4513    0.4779   11.1487 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   13.1752    0.6845   10.5704 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   11.1789    0.6212   10.6922 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   11.0329    0.9278    9.8052 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   10.0578    0.3183   11.5260 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   10.3151   -0.2045  12.8402 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   11.6670   -0.3397   13.2758 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   11.8381   -0.6904   14.1420 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   8.7415    0.5117   11.1075 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   8.5780    0.8602   10.2388 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
  15.1262    2.9048    9.2569 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  14.9041    2.3548    8.5150 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  16.4354    2.9254    9.7236 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  17.0984    2.3968    9.2952 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  16.7783    3.7128   10.8083 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  17.6753    3.7326   11.1204 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  15.8028    4.4730   11.4356 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  16.0291    5.0060   12.1887 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  14.4947    4.4583   10.9677 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  13.8365    4.9854   11.4047 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  14.1295    3.6811    9.8633 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  12.7296    3.6539    9.3576 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  12.4513    3.1981    8.0262 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  13.1752    2.9915    7.4479 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  11.1789    3.0548    7.5697 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  11.0329    2.7482    6.6827 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  10.0578    3.3577    8.4035 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  10.3151    3.8805    9.7177 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  11.6670    4.0157   10.1533 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  11.8381    4.3664   11.0195 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  8.7415    3.1643    7.9850 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  8.5780    2.8158    7.1163 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  2.8457   -0.7712   12.3980 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  3.0678   -1.3212   13.1399 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  1.5364   -0.7506   11.9312 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  0.8734   -1.2792   12.3596 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  1.1935    0.0368   10.8466 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  0.2965    0.0566   10.5345 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  2.1690    0.7970   10.2192 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  1.9428    1.3300    9.4661 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
  3.4772    0.7823   10.6872 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  4.1353    1.3094   10.2501 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  3.8424    0.0051   11.7916 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  5.2422   -0.0221   12.2972 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  5.5206   -0.4779   13.6287 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  4.7967   -0.6845   14.2070 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  6.7930   -0.6212   14.0852 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  6.9389   -0.9278   14.9722 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  7.9141   -0.3183   13.2513 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  7.6567    0.2045   11.9372 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  6.3049    0.3397   11.5015 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  6.1338    0.6904   10.6354 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  9.2303   -0.5117   13.6699 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
  9.3939   -0.8602   14.5386 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  2  1  1  0  0  0   3  1  4  0  0  0
  4  3  1  0  0  0
  5  3  4  0  0  0
  6  5  1  0  0  0
  7  5  4  0  0  0
  8  7  1  0  0  0
  9  7  4  0  0  0
10  9  1  0  0  0
11  1  4  0  0  0
11  9  4  0  0  0
12 11  1  0  0  0
13 12  4  0  0  0
14 13  1  0  0  0
15 13  4  0  0  0
16 15  1  0  0  0
17 15  4  0  0  0
18 17  4  0  0  0
19 18  4  0  0  0
19 12  4  0  0  0
20 19  1  0  0  0
21 17  4  0  0  0
22 21  1  0  0  0
18 65  4  0  0  0
24 23  1  0  0  0
25 23  4  0  0  0
26 25  1  0  0  0
27 25  4  0  0  0
28 27  1  0  0  0
29 27  4  0  0  0
30 29  1  0  0  0
31 29  4  0  0  0
32 31  1  0  0  0
33 23  4  0  0  0
33 31  4  0  0  0
34 33  1  0  0  0
35 34  4  0  0  0
36 35  1  0  0  0
37 35  4  0  0  0
38 37  1  0  0  0
39 37  4  0  0  0
40 39  4  0  0  0
41 40  4  0  0  0
41 34  4  0  0  0
42 41  1  0  0  0
43 39  4  0  0  0
44 43  1  0  0  0
40 87  4  0  0  0
46 45  1  0  0  0
47 45  4  0  0  0
48 47  1  0  0  0
49 47  4  0  0  0
50 49  1  0  0  0
51 49  4  0  0  0
52 51  1  0  0  0
53 51  4  0  0  0
54 53  1  0  0  0
55 45  4  0  0  0
55 53  4  0  0  0
56 55  1  0  0  0
57 56  4  0  0  0
58 57  1  0  0  0
59 57  4  0  0  0
60 59  1  0  0  0
61 59  4  0  0  0
62 61  4  0  0  0
63 62  4  0  0  0
63 56  4  0  0  0
64 63  1  0  0  0
65 61  4  0  0  0
66 65  1  0  0  0
62 21  4  0  0  0
68 67  1  0  0  0
69 67  4  0  0  0
70 69  1  0  0  0
71 69  4  0  0  0
72 71  1  0  0  0
73 71  4  0  0  0
74 73  1  0  0  0
75 73  4  0  0  0
76 75  1  0  0  0
77 67  4  0  0  0
77 75  4  0  0  0
78 77  1  0  0  0
79 78  4  0  0  0
80 79  1  0  0  0
81 79  4  0  0  0
82 81  1  0  0  0
83 81  4  0  0  0
84 83  4  0  0  0
85 84  4  0  0  0
85 78  4  0  0  0
86 85  1  0  0  0
87 83  4  0  0  0
88 87  1  0  0  0
84 43  4  0  0  0
M  END

最后,辛苦大佬们解答疑惑!!!





作者
Author:
量化新生    时间: 2021-7-31 10:33
本帖最后由 量化新生 于 2021-7-31 15:03 编辑

mol文件有一丢丢问题,串行了两个,重新附上
DPA-dimer
  MatStudio         3D                             0
88 96  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000
   2.8457    4.4472    9.2755 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   3.0678    4.9972   10.0174 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   1.5364    4.4266    8.8087 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   0.8734    4.9552    9.2371 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   1.1935    3.6392    7.7241 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   0.2965    3.6194    7.4120 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   2.1690    2.8790    7.0967 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   1.9428    2.3460    6.3436 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   3.4772    2.8937    7.5647 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   4.1353    2.3666    7.1276 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   3.8424    3.6709    8.6691 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   5.2422    3.6981    9.1747 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   5.5206    4.1539   10.5062 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   4.7967    4.3605   11.0845 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   6.7930    4.2972   10.9627 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   6.9389    4.6038   11.8497 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   7.9141    3.9943   10.1288 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   7.6567    3.4715    8.8147 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   6.3049    3.3363    8.3790 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   6.1338    2.9856    7.5129 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   9.2303    4.1877   10.5474 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   9.3939    4.5362   11.4161 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   15.1262    0.7712   12.3794 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   14.9041    1.3212   11.6375 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   16.4354    0.7506   12.8461 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   17.0984    1.2792   12.4177 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   16.7783   -0.0368   13.9308 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   17.6753   -0.0566   14.2429 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   15.8028   -0.7970   14.5581 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   16.0291   -1.3300   15.3112 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   14.4947   -0.7823   14.0902 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   13.8365   -1.3094   14.5272 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   14.1295   -0.0051   12.9858 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   12.7296    0.0221   12.4801 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   12.4513    0.4779   11.1487 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   13.1752    0.6845   10.5704 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   11.1789    0.6212   10.6922 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
   11.0329    0.9278    9.8052 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   10.0578    0.3183   11.5260 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
   10.3151   -0.2045  12.8402 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   11.6670   -0.3397   13.2758 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   11.8381   -0.6904   14.1420 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   8.7415    0.5117   11.1075 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
   8.5780    0.8602   10.2388 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
  15.1262    2.9048    9.2569 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  14.9041    2.3548    8.5150 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  16.4354    2.9254    9.7236 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  17.0984    2.3968    9.2952 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  16.7783    3.7128   10.8083 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  17.6753    3.7326   11.1204 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  15.8028    4.4730   11.4356 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  16.0291    5.0060   12.1887 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  14.4947    4.4583   10.9677 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  13.8365    4.9854   11.4047 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  14.1295    3.6811    9.8633 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  12.7296    3.6539    9.3576 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  12.4513    3.1981    8.0262 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  13.1752    2.9915    7.4479 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  11.1789    3.0548    7.5697 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  11.0329    2.7482    6.6827 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  10.0578    3.3577    8.4035 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  10.3151    3.8805    9.7177 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  11.6670    4.0157   10.1533 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  11.8381    4.3664   11.0195 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  8.7415    3.1643    7.9850 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  8.5780    2.8158    7.1163 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  2.8457   -0.7712   12.3980 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  3.0678   -1.3212   13.1399 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  1.5364   -0.7506   11.9312 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  0.8734   -1.2792   12.3596 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  1.1935    0.0368   10.8466 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  0.2965    0.0566   10.5345 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  2.1690    0.7970   10.2192 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  1.9428    1.3300    9.4661 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
  3.4772    0.7823   10.6872 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  4.1353    1.3094   10.2501 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  3.8424    0.0051   11.7916 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  5.2422   -0.0221   12.2972 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  5.5206   -0.4779   13.6287 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  4.7967   -0.6845   14.2070 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  6.7930   -0.6212   14.0852 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  6.9389   -0.9278   14.9722 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  7.9141   -0.3183   13.2513 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  7.6567    0.2045   11.9372 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  6.3049    0.3397   11.5015 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  6.1338    0.6904   10.6354 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  
  9.2303   -0.5117   13.6699 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0   
  9.3939   -0.8602   14.5386 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  2  1  1  0  0  0
  3  1  4  0  0  0
  4  3  1  0  0  0
  5  3  4  0  0  0
  6  5  1  0  0  0
  7  5  4  0  0  0
  8  7  1  0  0  0
  9  7  4  0  0  0
10  9  1  0  0  0
11  1  4  0  0  0
11  9  4  0  0  0
12 11  1  0  0  0
13 12  4  0  0  0
14 13  1  0  0  0
15 13  4  0  0  0
16 15  1  0  0  0
17 15  4  0  0  0
18 17  4  0  0  0
19 18  4  0  0  0
19 12  4  0  0  0
20 19  1  0  0  0
21 17  4  0  0  0
22 21  1  0  0  0
18 65  4  0  0  0
24 23  1  0  0  0
25 23  4  0  0  0
26 25  1  0  0  0
27 25  4  0  0  0
28 27  1  0  0  0
29 27  4  0  0  0
30 29  1  0  0  0
31 29  4  0  0  0
32 31  1  0  0  0
33 23  4  0  0  0
33 31  4  0  0  0
34 33  1  0  0  0
35 34  4  0  0  0
36 35  1  0  0  0
37 35  4  0  0  0
38 37  1  0  0  0
39 37  4  0  0  0
40 39  4  0  0  0
41 40  4  0  0  0
41 34  4  0  0  0
42 41  1  0  0  0
43 39  4  0  0  0
44 43  1  0  0  0
40 87  4  0  0  0
46 45  1  0  0  0
47 45  4  0  0  0
48 47  1  0  0  0
49 47  4  0  0  0
50 49  1  0  0  0
51 49  4  0  0  0
52 51  1  0  0  0
53 51  4  0  0  0
54 53  1  0  0  0
55 45  4  0  0  0
55 53  4  0  0  0
56 55  1  0  0  0
57 56  4  0  0  0
58 57  1  0  0  0
59 57  4  0  0  0
60 59  1  0  0  0
61 59  4  0  0  0
62 61  4  0  0  0
63 62  4  0  0  0
63 56  4  0  0  0
64 63  1  0  0  0
65 61  4  0  0  0
66 65  1  0  0  0
62 21  4  0  0  0
68 67  1  0  0  0
69 67  4  0  0  0
70 69  1  0  0  0
71 69  4  0  0  0
72 71  1  0  0  0
73 71  4  0  0  0
74 73  1  0  0  0
75 73  4  0  0  0
76 75  1  0  0  0
77 67  4  0  0  0
77 75  4  0  0  0
78 77  1  0  0  0
79 78  4  0  0  0
80 79  1  0  0  0
81 79  4  0  0  0
82 81  1  0  0  0
83 81  4  0  0  0
84 83  4  0  0  0
85 84  4  0  0  0
85 78  4  0  0  0
86 85  1  0  0  0
87 83  4  0  0  0
88 87  1  0  0  0
84 43  4  0  0  0
M  END

作者
Author:
sobereva    时间: 2021-7-31 10:37
量化新生 发表于 2021-7-31 10:33
mol文件有一丢丢问题,串行了两个,重新附上
DPA-dimer
  MatStudio         3D                         ...

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了
作者
Author:
量化新生    时间: 2021-7-31 15:06
sobereva 发表于 2021-7-31 10:37
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员 ...

抱歉抱歉,我以为发完贴就编辑不了了。不好意思。主要还是望解答疑惑,萌新下次注意
作者
Author:
sobereva    时间: 2021-8-1 10:34
分清楚3.8和3.8(dev),前者迄今没发布过


就是你说的含义。Multiwfn目前只能基于TrESP电荷近似计算,没法按照你截图里那个式子严格按照积分来计算。
怎么算在4.A.9第三部分已经明确描述了,先用Multiwfn算相应跃迁对应的TrESP电荷,再通过TrESP电荷让Multiwfn直接根据库仑公式计算


就是优化基态二聚体结构(如果你想计算其它有特殊意义的结构下的激子耦合也可以用其它结构)


明显不能直接用B3LYP优化,这是弱相互作用体系最基本的计算常识,仔细看
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的
http://sobereva.com/557http://bbs.keinsci.com/thread-17899-1-1.html

你贴的文件我没法正常载入
mol不可能不能上传,例: (, 下载次数 Times of downloads: 1)
重新用恰当的级别优化、算激发态,如果还有问题,直接上传结构文件我再看


你说的那篇文章我目前没时间看。你可以看看之前一些Multiwfn用户通过Multiwfn算TrESP研究库仑耦合的文章,试图予以重复:
J. Phys. Chem. Lett. 2020, 11, 7908−7913
Chemical Physics https://doi.org/10.1016/j.chemphys.2019.110439
J. Phys. Chem. B 2020, 124, 10653−10662
Phys. Chem. Chem. Phys. DOI: 10.1039/c9cp05753f
NATURE COMMUNICATIONS, (2019) 10, 2048


作者
Author:
chunlinxxx    时间: 2024-11-13 18:09
本帖最后由 chunlinxxx 于 2024-11-13 18:11 编辑

请问老师们,如果只考虑晶体环境,用默认Multiwfn计算需要考虑特定的真空电容率值吗?我看文献公式前面还乘以了一个1/(4πε0)项
作者
Author:
sobereva    时间: 2024-11-14 06:03
chunlinxxx 发表于 2024-11-13 18:09
请问老师们,如果只考虑晶体环境,用默认Multiwfn计算需要考虑特定的真空电容率值吗?我看文献公式前面还乘 ...

Multiwfn用的原子单位,此时没1/(4πε0)
作者
Author:
chunlinxxx    时间: 2024-11-14 07:50
sobereva 发表于 2024-11-14 06:03
Multiwfn用的原子单位,此时没1/(4πε0) ...

谢谢老大。那所得的值默认就是真空吗
作者
Author:
sobereva    时间: 2024-11-14 08:16
chunlinxxx 发表于 2024-11-14 07:50
谢谢老大。那所得的值默认就是真空吗






欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3